uk.ac.ebi.intact.model.util.XrefUtils.createIdentityXrefPsiMi()方法的使用及代码示例

转载 作者：知者 更新时间：2024-03-22 22:53:05 27 4

protected CvObjectXref createIdentityXref( CvObject parent, String id ) {
  CvObjectXref idXref = null;
  if (id != null) {
    if (id.startsWith("MI")) {
      idXref = XrefUtils.createIdentityXrefPsiMi(parent, id);
      idXref.prepareParentMi();
    } else if (id.startsWith("IA")) {
      idXref = XrefUtils.createIdentityXref(parent, id, nonMiCvDatabase);
    } else if (id.startsWith("MOD")) {
      idXref = XrefUtils.createIdentityXref(parent, id, psimod);
    } else {
      if (log.isWarnEnabled()) log.warn("Uknown prefix for id: "+id+". Will store as a cross reference to database: "+nonMiCvDatabase.getShortLabel());
      idXref = XrefUtils.createIdentityXref(parent, id, nonMiCvDatabase);
    }
  }
  return idXref;
}

public static <T extends CvObject> T createCvObject(Institution institution, Class<T> cvClass, String primaryId, String shortLabel) {
    T cv = ClassUtils.newInstance(cvClass);
    cv.setOwner(institution);
    cv.setShortLabel(shortLabel);

    CvObjectXref idXref = XrefUtils.createIdentityXrefPsiMi(cv, primaryId);
    cv.addXref(idXref);

    return cv;
  }
}

public static <T extends CvObject> T createCvObject(Institution institution, Class<T> cvClass, String miIdentifier, String shortLabel) {
  T cv = ClassUtils.newInstance(cvClass);
  cv.setOwner(institution);
  cv.setShortLabel(shortLabel);
  cv.setIdentifier(miIdentifier);
  if (miIdentifier != null) {
    CvObjectXref idXref = XrefUtils.createIdentityXrefPsiMi(cv, miIdentifier);
    cv.addXref(idXref);
    idXref.prepareParentMi();
  }
  return cv;
}

public static <T extends CvObject> T createCvObject(Institution institution, Class<T> cvClass, String miIdentifier, String shortLabel) {
  T cv = ClassUtils.newInstance(cvClass);
  cv.setOwner(institution);
  cv.setShortLabel(shortLabel);
  cv.setIdentifier(miIdentifier);
  if (miIdentifier != null) {
    CvObjectXref idXref = XrefUtils.createIdentityXrefPsiMi(cv, miIdentifier);
    cv.addXref(idXref);
    idXref.prepareParentMi();
  }
  return cv;
}

InstitutionXref xref = XrefUtils.createIdentityXrefPsiMi(institution, Institution.INTACT_REF);
institution.addXref(xref);
InstitutionXref xref = XrefUtils.createIdentityXrefPsiMi(institution, Institution.MINT_REF);
institution.addXref(xref);

27 4 0

• Ruby 方法() 方法

  我想了解 Ruby 方法 methods() 是如何工作的。 我尝试使用“ruby 方法”在 Google 上搜索，但这不是我需要的。 我也看过 ruby​​-doc.org，但我没有找到这种方法。

• VBS教程：方法-Test 方法

  Test 方法 对指定的字符串执行一个正则表达式搜索，并返回一个 Boolean 值指示是否找到匹配的模式。 object.Test(string) 参数 object 必选项。总是一个

• VBS教程：方法-Replace 方法

  Replace 方法 替换在正则表达式查找中找到的文本。 object.Replace(string1, string2) 参数 object 必选项。总是一个 RegExp 对象的名称。

• VBS教程：方法-Raise 方法

  Raise 方法 生成运行时错误 object.Raise(number, source, description, helpfile, helpcontext) 参数 object 应为

• VBS教程：方法-Execute 方法

  Execute 方法 对指定的字符串执行正则表达式搜索。 object.Execute(string) 参数 object 必选项。总是一个 RegExp 对象的名称。 string

• VBS教程：方法-Clear 方法

  Clear 方法 清除 Err 对象的所有属性设置。 object.Clear object 应为 Err 对象的名称。 说明 在错误处理后，使用 Clear 显式地清除 Err 对象。此

• VBS教程：方法-CopyFile 方法

  CopyFile 方法 将一个或多个文件从某位置复制到另一位置。 object.CopyFile source, destination[, overwrite] 参数 object 必选

• VBS教程：方法-Copy 方法

  Copy 方法 将指定的文件或文件夹从某位置复制到另一位置。 object.Copy destination[, overwrite] 参数 object 必选项。应为 File 或 F

• VBS教程：方法-Close 方法

  Close 方法 关闭打开的 TextStream 文件。 object.Close object 应为 TextStream 对象的名称。 说明 下面例子举例说明如何使用 Close 方

• VBS教程：方法-BuildPath 方法

  BuildPath 方法 向现有路径后添加名称。 object.BuildPath(path, name) 参数 object 必选项。应为 FileSystemObject 对象的名称

• VBS教程：方法-GetFolder 方法

  GetFolder 方法 返回与指定的路径中某文件夹相应的 Folder 对象。 object.GetFolder(folderspec) 参数 object 必选项。应为 FileSy

• VBS教程：方法-GetFileName 方法

  GetFileName 方法 返回指定路径（不是指定驱动器路径部分）的最后一个文件或文件夹。 object.GetFileName(pathspec) 参数 object 必选项。应为

• VBS教程：方法-GetFile 方法

  GetFile 方法 返回与指定路径中某文件相应的 File 对象。 object.GetFile(filespec) 参数 object 必选项。应为 FileSystemObject

• VBS教程：方法-GetExtensionName 方法

  GetExtensionName 方法 返回字符串，该字符串包含路径最后一个组成部分的扩展名。 object.GetExtensionName(path) 参数 object 必选项。应

• VBS教程：方法-GetDriveName 方法

  GetDriveName 方法 返回包含指定路径中驱动器名的字符串。 object.GetDriveName(path) 参数 object 必选项。应为 FileSystemObjec

• VBS教程：方法-GetDrive 方法

  GetDrive 方法 返回与指定的路径中驱动器相对应的 Drive 对象。 object.GetDrive drivespec 参数 object 必选项。应为 FileSystemO

• VBS教程：方法-GetBaseName 方法

  GetBaseName 方法 返回字符串，其中包含文件的基本名 (不带扩展名), 或者提供的路径说明中的文件夹。 object.GetBaseName(path) 参数 object 必

• VBS教程：方法-GetAbsolutePathName 方法

  GetAbsolutePathName 方法 从提供的指定路径中返回完整且含义明确的路径。 object.GetAbsolutePathName(pathspec) 参数 object

• VBS教程：方法-FolderExists 方法

  FolderExists 方法 如果指定的文件夹存在，则返回 True；否则返回 False。 object.FolderExists(folderspec) 参数 object 必选项

• VBS教程：方法-FileExists 方法

  FileExists 方法 如果指定的文件存在返回 True；否则返回 False。 object.FileExists(filespec) 参数 object 必选项。应为 FileS