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【Flink】Flink Sort-Shuffle写流程简析

转载 作者:知者 更新时间:2024-03-12 23:02:09 26 4
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1.概述

转载:Flink Sort-Shuffle写流程简析 转载并且补充。

2.配置

taskmanager.network.sort-shuffle.min-parallelism

核心配置。设置Hash Shuffle和Sort Shuffle的分界。并发数大于该值时,使用Sort Shuffle。默认是int最大值,即使用Hash Shuffle。

taskmanager.network.sort-shuffle.min-buffers

每个Sort Shuffle的Result Partition使用的最小buffer数,默认64,推荐生产使用2048,但可能需要增大网络内存配置。

taskmanager.network.blocking-shuffle.compression.enabled

是否启用压缩

3.初始创建

实现类:SortMergeResultPartition

类的创建在ResultPartitionFactorycreate()方法中,根据不同的配置,会选择使用不同的ResultPartition,总共三种:PipelinedResultPartitionSortMergeResultPartitionBoundedBlockingResultPartition。其中PipelinedResultPartition用于流模式,其他的用于批模式。

创建SortMergeResultPartition的分支条件如下

} else if (type == ResultPartitionType.BLOCKING
                || type == ResultPartitionType.BLOCKING_PERSISTENT) {
            /**
             * 在ResultPartitionFactory的create()方法中,根据不同的配置,会选择使用不同的
             * ResultPartition,总共三种:PipelinedResultPartition、SortMergeResultPartition、
             * BoundedBlockingResultPartition。其中PipelinedResultPartition用于流模式,
             * 其他的用于批模式。
             */
            if (numberOfSubpartitions >= sortShuffleMinParallelism) {
                partition =
                        new SortMergeResultPartition(
                                taskNameWithSubtaskAndId,
                                partitionIndex,
                                id,
                                type,
                                subpartitions.length,
                                maxParallelism,
                                batchShuffleReadBufferPool,
                                batchShuffleReadIOExecutor,
                                partitionManager,
                                channelManager.createChannel().getPath(),
                                bufferCompressor,
                                bufferPoolFactory);

4、成员变量

NUM_WRITE_BUFFER_BYTES

int类型的数值,表示为数据写入设置的buffer大小,目前固定16M,不可配置。

resultFile

PartitionedFile类型,是Sort-Merge Shuffle的持久化文件代表,包含两个文件:.shuffle.data、.shuffle.index。文件根目录在tmp。

数据文件内分为多个区域,每个区域内,相同的子分区的数据相邻存储。索引条目是(long,int)类型,long代表文件偏移量,int代表buffer数量。

writeSegments

List<MemorySegment>类型,从网络buffer切出来的用于数据写入的buffer。其中,numRequiredBuffer来源在ResultPartitionFactory中,根据shuffle类型,选择不同的值,其值来源配置:taskmanager.network.sort-shuffle.min-buffers

int expectedWriteBuffers = NUM_WRITE_BUFFER_BYTES / networkBufferSize;
if (networkBufferSize > NUM_WRITE_BUFFER_BYTES) {
    expectedWriteBuffers = 1;
}

int numRequiredBuffer = bufferPool.getNumberOfRequiredMemorySegments();
int numWriteBuffers = Math.min(numRequiredBuffer / 2, expectedWriteBuffers);
int numRequiredBuffers =
    !type.isPipelined() && numberOfSubpartitions >= sortShuffleMinParallelism
    ? sortShuffleMinBuffers
    : numberOfSubpartitions + 1;

networkBufferSize

int类型的数值,网络缓冲区和写缓冲区的大小(buffer的大小),其值来源pageSize,由taskmanager.memory.segment-size设定

fileWriter

PartitionedFileWriter类型,此ResultPartition的文件输出器。

subpartitionOrder

int[]类型,分区的顺序,用于写入数据文件时的分区顺序。

readScheduler

SortMergeResultPartitionReadScheduler类型,分区数据读取调度器。

numBuffersForSort

int类型的数值,unicastSortBuffer和broadcastSortBuffer可使用的buffer数。

broadcastSortBuffer

SortBuffer类型,用于broadcastRecord使用的buffer

unicastSortBuffer

SortBuffer类型,用于飞broadcastRecord使用的buffer

5.写shuffle文件

基于数据收发的内容,数据发送按RecordWriteOutput的collect方法开始

RecordWriteOutput.collect()
    ->pushToRecordWriter()
        ->RecordWriter.emit()
            ->ResultPartitionWriter.emitRecord()
                ->SortMergeResultPartition.emitRecord()

5.1 获取SortBuffer

首先判断是否是Broadcast数据,然后根据条件,创建新的buffer并返回

private void emit(
            ByteBuffer record, int targetSubpartition, DataType dataType, boolean isBroadcast)
            throws IOException {
        checkInProduceState();

        SortBuffer sortBuffer = isBroadcast ? getBroadcastSortBuffer() : getUnicastSortBuffer();
        if (sortBuffer.append(record, targetSubpartition, dataType)) {
            return;
        }

getUnicastSortBuffer()方法中,主要做两件事:1、flush Broadcast的buffer;2、创建新的buffer并返回。

private SortBuffer getBroadcastSortBuffer() throws IOException {
        flushUnicastSortBuffer();

        if (broadcastSortBuffer != null && !broadcastSortBuffer.isFinished()) {
            return broadcastSortBuffer;
        }

        broadcastSortBuffer =
                new PartitionSortedBuffer(
                        lock,
                        bufferPool,
                        numSubpartitions,
                        networkBufferSize,
                        numBuffersForSort,
                        subpartitionOrder);
        return broadcastSortBuffer;
    }

5.2、追加数据

此步骤将产生的数据写入上一节产生的SortBuffer当中。注意这边的判断条件,当数据过大没有足够buffer写入时才会向下执行,否则写入完成后退出方法

private void emit(
            ByteBuffer record, int targetSubpartition, DataType dataType, boolean isBroadcast)
            throws IOException {
        checkInProduceState();

        SortBuffer sortBuffer = isBroadcast ? getBroadcastSortBuffer() : getUnicastSortBuffer();
        // 这一句
        if (sortBuffer.append(record, targetSubpartition, dataType)) {
            return;
        }

这里调用org.apache.flink.runtime.io.network.partition.PartitionSortedBuffer#append

@Override
    public boolean append(ByteBuffer source, int targetChannel, DataType dataType)
            throws IOException {
        checkArgument(source.hasRemaining(), "Cannot append empty data.");
        checkState(!isFinished, "Sort buffer is already finished.");
        checkState(!isReleased, "Sort buffer is already released.");

        int totalBytes = source.remaining();

        // return false directly if it can not allocate enough buffers for the given record
        if (!allocateBuffersForRecord(totalBytes)) {
            return false;
        }

写入数据的时候会在前部先写入一个元数据信息

// return false directly if it can not allocate enough buffers for the given record
        if (!allocateBuffersForRecord(totalBytes)) {
            return false;
        }

        // write the index entry and record or event data
        //   写入数据的时候会在前部先写入一个元数据信息
        writeIndex(targetChannel, totalBytes, dataType);
        writeRecord(source);

        ++numTotalRecords;
        numTotalBytes += totalBytes;

5.3、buffer不足的处理

此步骤是4.2步骤buffer不足的后续处理,如果数据已经全部读出,则释放该buffer并采用其他方式写入过大的数据

private void emit(
            ByteBuffer record, int targetSubpartition, DataType dataType, boolean isBroadcast)
            throws IOException {
        checkInProduceState();

        SortBuffer sortBuffer = isBroadcast ? getBroadcastSortBuffer() : getUnicastSortBuffer();
        if (sortBuffer.append(record, targetSubpartition, dataType)) {
            return;
        }

        //  此步骤是4.2步骤buffer不足的后续处理,如果数据已经全部读出,则释放该buffer并采用其他方式写入过大的数据
        if (!sortBuffer.hasRemaining()) {
            // the record can not be appended to the free sort buffer because it is too large
            sortBuffer.finish();
            sortBuffer.release();
            writeLargeRecord(record, targetSubpartition, dataType, isBroadcast);
            return;
        }

5.4、buffer不足数据未读完

此步骤接续4.3,当buffer不足以写入新数据且数据未被写入shuffle文件时,增加shuffle出文件的操作并重新调用写数据方法

//  此步骤接续4.3,当buffer不足以写入新数据且数据未被写入shuffle文件时,增加shuffle出文件的操作并重新调用写数据方法
        flushSortBuffer(sortBuffer, isBroadcast);
        emit(record, targetSubpartition, dataType, isBroadcast);
    }

6.关于排序

PartitionSortedBuffer是会进行排序的buffer,依赖于内部的MemorySegment列表作为缓冲。相关的一些成员变量如下,index和segment使用的是同一份MemorySegment列表

/** A segment list as a joint buffer which stores all records and index entries. */
@GuardedBy("lock")
private final ArrayList<MemorySegment> segments = new ArrayList<>();

/** Addresses of the first record's index entry for each subpartition. */
private final long[] firstIndexEntryAddresses;

/** Addresses of the last record's index entry for each subpartition. */
private final long[] lastIndexEntryAddresses;

/** Array index in the segment list of the current available buffer for writing. */
private int writeSegmentIndex;

/** Next position in the current available buffer for writing. */
private int writeSegmentOffset;

6.1、segment申请

根据第四章内容,添加数据有如下调用链:emit()->append()->allocateBuffersForRecord()
  
  allocateBuffersForRecord是申请segment用来存储数据的。当segment不足时,向bufferPool申请新资源。注意初始的时候,segment的列表是空的,所以最初必然是会申请的。
  
  注意,一个segment是可能写多个数据的,如下,writeSegmentOffset是当前segment的写入位置,如果剩余量充足,是会继续写入数据的。

int availableBytes =
    writeSegmentIndex == segments.size() ? 0 : bufferSize - writeSegmentOffset;

// return directly if current available bytes is adequate
if (availableBytes >= numBytesRequired) {
    return true;
}

6.2、writeIndex

在落地文件层,index和数据是分文件的,在PartitionedFile的定义如下

public static final String DATA_FILE_SUFFIX = ".shuffle.data";

public static final String INDEX_FILE_SUFFIX = ".shuffle.index";

PartitionSortedBuffer的writeIndex方法完成index向segment的写入,详细如下

6.2.1.获取当前可用segment

获取当前可用的segment,内部使用writeSegmentIndex记录segments列表当中segment的下表

MemorySegment segment = segments.get(writeSegmentIndex);

6.2.2、写入index到segment

写入index到segment,一个index是一个long数据,占64位。其中,高32位记录数据长度,低32位记录数据类型。此处用到了long64位、int32位、位运算相关知识。<<是左移符号

// record length takes the high 32 bits and data type takes the low 32 bits
segment.putLong(writeSegmentOffset, ((long) numRecordBytes << 32) | dataType.ordinal());

6.2.3、更新partition最后数据的索引

更新对应partition的最后数据的索引。

lastIndexEntryAddresses是一个列表,大小与分区数对应,每一项记录对应分区的最新数据的索引地址。

索引地址即indexEntryAddress,也是一个long类型的数据,高32位只想segments列表中对应segment的下标,低32位指向segment内部的偏移量。此结构式后续排序的一个基础。

// segment index takes the high 32 bits and segment offset takes the low 32 bits
long indexEntryAddress = ((long) writeSegmentIndex << 32) | writeSegmentOffset;

long lastIndexEntryAddress = lastIndexEntryAddresses[channelIndex];
lastIndexEntryAddresses[channelIndex] = indexEntryAddress;

6…2.4、分区前后数据关联

此步骤是将新数据的索引附加在上一个数据索引的后面,如果没有上一个数据,直接放入firstIndexEntryAddresses,表示当前数据是此分区最早的数据

if (lastIndexEntryAddress >= 0) {
    // link the previous index entry of the given channel to the new index entry
    segment = segments.get(getSegmentIndexFromPointer(lastIndexEntryAddress));
    segment.putLong(getSegmentOffsetFromPointer(lastIndexEntryAddress) + 8, indexEntryAddress);
} else {
    firstIndexEntryAddresses[channelIndex] = indexEntryAddress;
}

以上,getSegmentIndexFromPointer和getSegmentOffsetFromPointer分别获取segment在列表中的下标以及segment内部的偏移量

private int getSegmentIndexFromPointer(long value) {
    return (int) (value >>> 32);
}

private int getSegmentOffsetFromPointer(long value) {
    return (int) (value);
}

getSegmentOffsetFromPointer(lastIndexEntryAddress) + 8的意思是:8即8 bytes,也就是64 bit,这是一个数据的索引的长度,也就是在前一个数据的索引后面加入添加上当前数据的索引。

关于segment索引后面预留一个index空间的来源。
  
成员变量INDEX_ENTRY_SIZE,这是一个4+4+8的值,也就是一个当前索引的长度+预留下一个索引的长度。

6.2.5、更新公共变量的值

此步骤主要更新writeSegmentOffset的值,也就是segment的内部偏移量,可以看到,一次性偏移了两个64位的量,也就是两个索引的位置

// move the write position forward so as to write the corresponding record
updateWriteSegmentIndexAndOffset(INDEX_ENTRY_SIZE);

private void updateWriteSegmentIndexAndOffset(int numBytes) {
    writeSegmentOffset += numBytes;

    // using the next available free buffer if the current is full
    if (writeSegmentOffset == bufferSize) {
        ++writeSegmentIndex;
        writeSegmentOffset = 0;
    }
}

6.3、writeRecord

此步骤用于写数据进segment。写数据步骤相对写index简单很多,就是直接将数据不断追加进segment

private void writeRecord(ByteBuffer source) {
    while (source.hasRemaining()) {
        MemorySegment segment = segments.get(writeSegmentIndex);
        int toCopy = Math.min(bufferSize - writeSegmentOffset, source.remaining());
        segment.put(writeSegmentOffset, source, toCopy);

        // move the write position forward so as to write the remaining bytes or next record
        updateWriteSegmentIndexAndOffset(toCopy);
    }
}

6.4、flushSortBuffer

此步骤用于将buffer中的数据写出到shuffle文件当中

6.4.1、启动新region

shuffle文件是按region存储的,每个region内,相同分区的数据写在一起,不同的region之间不保证。向shuffl文件输出的写操作的实现类是PartitionedFileWriter

fileWriter.startNewRegion(isBroadcast);

此处会调用到PartitionedFileWriter的writeRegionIndex方法,这个方法初次进入不做操作,开启第二个region开始才会进行执行。

private void writeRegionIndex() throws IOException {
    if (Arrays.stream(subpartitionBuffers).sum() > 0) {
        for (int channel = 0; channel < numSubpartitions; ++channel) {
            writeIndexEntry(subpartitionOffsets[channel], subpartitionBuffers[channel]);
        }

        currentSubpartition = -1;
        ++numRegions;
        Arrays.fill(subpartitionBuffers, 0);
    }
}

private void writeIndexEntry(long subpartitionOffset, int numBuffers) throws IOException {
    if (!indexBuffer.hasRemaining()) {
        if (!extendIndexBufferIfPossible()) {
            flushIndexBuffer();
            indexBuffer.clear();
            allIndexEntriesCached = false;
        }
    }

    indexBuffer.putLong(subpartitionOffset);
    indexBuffer.putInt(numBuffers);
}

相关的PartitionedFileWriter的成员如下

  1. subpartitionBuffers,分区写入的buffer数
  2. subpartitionOffsets,分区写入的偏移,也就是记录写入的数据量(bytes)
  3. indexBuffer,用于写入index的buffer,满了会溢出写到文件,此处写入index文件
  4. subpartitionBuffers是一个数组,每一项记录了对应分区写出的buffer数,写出数据的时候会增加。此处Arrays.stream(subpartitionBuffers).sum() > 0就是判断已经存在文件输出了
  5. subpartitionOffsets代表数据在文件中的偏移量,写数据的时候会更新,就是统计输出到文件的bytes数

6.4.2、构建基础对象

这一步构建两个基础对象List<BufferWithChannel> toWrite、Queue<MemorySegment> segments。其中toWrite用于后续向文件输出,segments是基于writeSegments列表克隆出来的一个队列。

private Queue<MemorySegment> getWriteSegments() {
    synchronized (lock) {
        checkState(!writeSegments.isEmpty(), "Task has been canceled.");
        return new ArrayDeque<>(writeSegments);
    }
}

6.4.3、copyIntoSegment

这一步是将segment的数据封装进buffer形成一个BufferWithChannel用于后续写出到文件。

6.4.3.1、获取分区号

subpartitionReadOrder列表设置了分区读取顺序,可以自定义;readOrderIndex设置了当前读取的分区

// 获取
int channelIndex = subpartitionReadOrder[readOrderIndex];

// subpartitionReadOrder定义
this.subpartitionReadOrder = new int[numSubpartitions];
if (customReadOrder != null) {
    checkArgument(customReadOrder.length == numSubpartitions, "Illegal data read order.");
    System.arraycopy(customReadOrder, 0, this.subpartitionReadOrder, 0, numSubpartitions);
} else {
    for (int channel = 0; channel < numSubpartitions; ++channel) {
        this.subpartitionReadOrder[channel] = channel;
    }
}
6…4.3.2、获取元数据信息

根据其中的数据,反向解析出对应的index信息。此步开始是一个循环调用的操作,注意如果已经读取部分数据并且下一个读的数据是event事件类型,则跳出循环

int sourceSegmentIndex = getSegmentIndexFromPointer(readIndexEntryAddress);
int sourceSegmentOffset = getSegmentOffsetFromPointer(readIndexEntryAddress);
MemorySegment sourceSegment = segments.get(sourceSegmentIndex);

long lengthAndDataType = sourceSegment.getLong(sourceSegmentOffset);
int length = getSegmentIndexFromPointer(lengthAndDataType);
DataType dataType = DataType.values()[getSegmentOffsetFromPointer(lengthAndDataType)];

// return the data read directly if the next to read is an event
if (dataType.isEvent() && numBytesCopied > 0) {
    break;
}
bufferDataType = dataType;

// get the next index entry address and move the read position forward
long nextReadIndexEntryAddress = sourceSegment.getLong(sourceSegmentOffset + 8);
sourceSegmentOffset += INDEX_ENTRY_SIZE;
6.4.3.3、copyRecordOrEvent

这一步就是将数据拷贝进克隆出来的segment中,注意这里只拷贝了数据。

6.4.3.4、读同分区下一个数据

前面读出了下一个数据的地址,此处如果当前读取的数据不是分区的最后一个数据,则继续读下一个数据。基于这一步的操作,完成了同分区写在一起的目的。

if (recordRemainingBytes == 0) {
    // move to next channel if the current channel has been finished
    if (readIndexEntryAddress == lastIndexEntryAddresses[channelIndex]) {
        updateReadChannelAndIndexEntryAddress();
        break;
    }
    readIndexEntryAddress = nextReadIndexEntryAddress;
}
6.4.3.5、封装buffer

这一步将segment封装成Buffer,再进一步添加分区号封装成BufferWithChannel

numTotalBytesRead += numBytesCopied;
Buffer buffer = new NetworkBuffer(target, (buf) -> {}, bufferDataType, numBytesCopied);
return new BufferWithChannel(buffer, channelIndex);

6.4.4、更新统计数据

这一步是更新统计相关的数据

private void updateStatistics(Buffer buffer, boolean isBroadcast) {
    numBuffersOut.inc(isBroadcast ? numSubpartitions : 1);
    long readableBytes = buffer.readableBytes();
    numBytesOut.inc(isBroadcast ? readableBytes * numSubpartitions : readableBytes);
}

6.4.5、compressBuffer

这一步根据情况,对buffer做压缩

private BufferWithChannel compressBufferIfPossible(BufferWithChannel bufferWithChannel) {
    Buffer buffer = bufferWithChannel.getBuffer();
    if (!canBeCompressed(buffer)) {
        return bufferWithChannel;
    }

    buffer = checkNotNull(bufferCompressor).compressToOriginalBuffer(buffer);
    return new BufferWithChannel(buffer, bufferWithChannel.getChannelIndex());
}

可压缩条件如下

protected boolean canBeCompressed(Buffer buffer) {
    return bufferCompressor != null && buffer.isBuffer() && buffer.readableBytes() > 0;
}

压缩类的创建如下,是批方式并且配置了压缩的情况下会创建压缩类

BufferCompressor bufferCompressor = null;
if (type.isBlocking() && blockingShuffleCompressionEnabled) {
    bufferCompressor = new BufferCompressor(networkBufferSize, compressionCodec);
}

最后会把buffer放入toWrite列表

toWrite.add(compressBufferIfPossible(bufferWithChannel));

6.4.6、buffer写出

这一步完成buffer数据向PartitionedFile的写出,使用PartitionedFileWriter。

fileWriter.writeBuffers(toWrite);
6.4.6.1、构建ByteBuffer

此处会构建一个BufferWithChannel列表两倍量的ByteBuffer,两倍的原因就是会有一个每个buffer会有一个头数据。

ByteBuffer[] bufferWithHeaders = new ByteBuffer[2 * bufferWithChannels.size()];
6.4.6.2、collectBroadcastBuffers

根据情况,broadcast和非broadcast会有不同的处理,待续

6.4.6.3、collectUnicastBuffers

这一步就是向bufferWithHeaders填充buffer和设置header的。过程就是循环获取BufferWithChannel,然后对 每个channel设置bufferWithHeaders。

根据sort-shuffle的特性,一个region内同分区的数据会写在一起,所以有一步分区判断,但是根据5.4.3.4的内容,数据是已经聚合过的,所以这一步判断肯定是过的。如下,当partition id变更的时候,那肯定就是新的id,以前是没有数据的,也就是subpartitionBuffers[subpartition] == 0

int subpartition = bufferWithChannels.get(i).getChannelIndex();
if (subpartition != currentSubpartition) {
    checkState(
            subpartitionBuffers[subpartition] == 0,
            "Must write data of the same channel together.");
    subpartitionOffsets[subpartition] = fileOffset;
    currentSubpartition = subpartition;
}

之后是设置bufferWithHeaders,可以看到index是2的倍数跳的。同时,此处会对一些数据做记录,比如分区的buffer数等。

Buffer buffer = bufferWithChannels.get(i).getBuffer();
int numBytes = setBufferWithHeader(buffer, bufferWithHeaders, 2 * i);
expectedBytes += numBytes;
fileOffset += numBytes;
++subpartitionBuffers[subpartition];

setBufferWithHeader的内容主要就是设置一个头信息,然后数据使用一个ByteBuffer存储(使用netty内部的实现)。此处bufferWithChannels传入的Buffer是一个NetworkBuffer

private int setBufferWithHeader(Buffer buffer, ByteBuffer[] bufferWithHeaders, int index) {
    ByteBuffer header = BufferReaderWriterUtil.allocatedHeaderBuffer();
    BufferReaderWriterUtil.setByteChannelBufferHeader(buffer, header);

    bufferWithHeaders[index] = header;
    bufferWithHeaders[index + 1] = buffer.getNioBufferReadable();

    return header.remaining() + buffer.readableBytes();
}

头信息的内容如下:1、数据类型;2、是否压缩;3、buffer大小

static void setByteChannelBufferHeader(Buffer buffer, ByteBuffer header) {
    header.clear();
    header.putShort(buffer.isBuffer() ? HEADER_VALUE_IS_BUFFER : HEADER_VALUE_IS_EVENT);
    header.putShort(buffer.isCompressed() ? BUFFER_IS_COMPRESSED : BUFFER_IS_NOT_COMPRESSED);
    header.putInt(buffer.getSize());
    header.flip();
}
6.4.6.4、collectUnicastBuffers

最后是写出数据,利用FileChannel写出5.4.6.3节的buffer内容。此处写出出到数据文件,index文件是在5.4.1当中写出的

totalBytesWritten += expectedBytes;
BufferReaderWriterUtil.writeBuffers(dataFileChannel, expectedBytes, bufferWithHeaders);

static void writeBuffers(FileChannel channel, long bytesExpected, ByteBuffer... buffers)
        throws IOException {
    // The FileChannel#write method relies on the writev system call for data writing on linux.
    // The writev system call has a limit on the maximum number of buffers can be written in one
    // invoke whose advertised value is 1024 (see writev man page for more information), which
    // means if more than 1024 buffers is written in one invoke, it is not guaranteed that all
    // bytes can be written, so we build this safety net.
    if (bytesExpected > channel.write(buffers)) {
        for (ByteBuffer buffer : buffers) {
            writeBuffer(channel, buffer);
        }
    }
}

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