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<分区>
大家，我有这个二进制矩阵
rownames <- c("gene1", "gene2", "gene3", "gene4")
colnames <- c("A", "B", "C", "D")
data <- matrix(c(1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1),nrow = 4, ncol = 4, byrow = TRUE, dimnames = list(rownames, colnames))
data
# A B C D
#gene1 1 0 1 0
#gene2 1 1 0 0
#gene3 1 0 1 0
#gene4 0 1 0 1
我想将数据转换成这个邻接矩阵用于网络 igraph 可视化。
A B C D
A 0 1 2 0
B 1 0 0 1
C 2 0 0 0
D 0 1 0 0
解释:从 A 中，gene2 与 B 共享分数“1”，这就是我得到 1 分的原因。从 A 中，gene1 和 gene3 与 C 共享分数“总分 2”，这就是它获得 2 分的原因
矩阵可以改成这样吗？我应该使用迭代吗？但我不知道。Tidyverse 方法将非常有帮助。
谢谢
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