r - 具有 Gamma 参数的渐变色标？

Question

我有一些对比度非常微弱且有相当多噪点的成像数据，当我使用线性色标显示时，显示效果不佳。在 imageJ 或 photoshop 等成像软件中，有一条色调曲线，可以对其进行调整以非线性方式增强对比度，并有效地拉伸(stretch)某些感兴趣区域的比例以查看更多细节。

作为这种非线性调整参数的最简单情况，@BrianDiggs 指出了 bias colorRamp 的参数，这仍然需要先前将数据转换为 [0, 1]。我想将非线性比例推广到除 x^gamma 以外的其他泛函，因此下面的函数实际上并没有使用 bias在 colorRamp但在数据端进行转换。

我觉得我正在重新发明轮子； R中已经有这样的连续色标工具了吗？

Answer 1

这是一个可能的解决方案，

set.seed(123)
x <- sort(runif(1e4, min=-20 , max=120))

library(scales) # rescale function

curve_pal <- function (x, colours = rev(blues9), 
                       fun = function(x) x^gamma,
                       n=10, gamma=1) 
{
    # function that maps [0,1] -> colours
    palfun <- colorRamp(colors=colours)

    # now divide the data in n equi-spaced regions, mapped linearly to [0,1]
    xcuts <- cut(x, breaks=seq(min(x), max(x), length=n))
    xnum <- as.numeric(xcuts)

    # need to work around NA values that make colorRamp/rgb choke
    testNA <- is.na(xnum)
    xsanitised <- ifelse(testNA, 0, fun(rescale(xnum))) 

    # non-NA values in [0,1] get assigned their colour
    ifelse(testNA, NA, rgb(palfun(xsanitised), maxColorValue=255))
}

library(gridExtra)
grid.newpage()
grid.arrange(rasterGrob(curve_pal(x, gamma=0.5), wid=1, heig=1, int=F),
             rasterGrob(curve_pal(x, gamma=1), wid=1, heig=1, int=F), 
             rasterGrob(curve_pal(x, gamma=2), wid=1, heig=1, int=F), 
             nrow=1)