- html - 出于某种原因,IE8 对我的 Sass 文件中继承的 html5 CSS 不友好?
- JMeter 在响应断言中使用 span 标签的问题
- html - 在 :hover and :active? 上具有不同效果的 CSS 动画
- html - 相对于居中的 html 内容固定的 CSS 重复背景?
我正在尝试在 R 中实现 Delta 方法来计算 Weibull 生存曲线的 MTTF 方差。形状参数是alpha,尺度参数是delta。方差 = var;协方差 = cov。
等式是:
var(mttf) = var(alpha)*[d(mttf)/d(alpha)]^2 +
2*cov(alpha,delta)*d(mttf)/d(alpha)*d(mttf)/d(delta)
+ var(delta)*[d(mttf/d(delta)]^2.
地点:
d(mttf)/d(alpha) = gamma(1+1/delta)
d(mttf)/d(delta) = -alpha/delta^2 * gamma(1+1/delta) * digamma(1+1/delta)
所以等式变成:
var(mttf) = var(alpha)*[gamma(1+1/delta)]^2 +
2*cov(alpha,delta)*gamma(1+1/delta)*(-alpha/delta^2 * gamma(1+1/delta) * digamma(1+1/delta))
+ var(delta)*[-alpha/delta^2 * gamma(1+1/delta) * digamma(1+1/delta)]^2
我可以从方差-协方差矩阵中获取var(alpha)、var(delta) 和cov(alpha,delta)。
拟合的 weibull 模型称为 ajust。
vcov(ajust)
a=ajust$var[2,2]*ajust$scale^2
b=ajust$var[1,2]*ajust$scale
matriz=matrix(c(ajust$var[1,1],b,b,a),ncol=2,nrow=2)
和
var(alpha) = matriz[2,2]
var(delta) = matriz[1,1]
cov(alpha,delta) = matriz[1,2] or matriz[2,1]
还有更多
alpha=coef[2]
delta=coef[1]
其中 coef 是一个变量,其中包含来自 survreg adjust 的参数 alpha 和 delta。
因此,计算 MTTF:
mttf<-coef[2]*(gamma((1+(1/coef[1]))))
并计算mttf方差:
var_mttf=matriz[2,2]*(gamma(1+1/coef[1]))^2+
2*matriz[1,2]*((-coef[2]/(coef[1]^2))*gamma(1+1/coef[1])*digamma(1+1/coef[1]))+
matriz[1,1]*((-coef[2]/(coef[1]^2))*gamma(1+1/coef[1])*digamma(1+1/coef[1]))^2
但不幸的是,我的 mttf 方差与我从互联网论文中获取的任何示例都不匹配。修改了太多次了...
整个代码是:
require(survival)
require(stats)
require(gnlm)
time<-c(0.22, 0.5, 0.88, 1.00, 1.32, 1.33, 1.54, 1.76, 2.50, 3.00, 3.00, 3.00, 3.00)
cens<-c(1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0)
#Weibull adjust with survreg
ajust<-survreg(Surv(time,cens)~1,dist='weibull')
alpha<-exp(ajust$coefficients[1])
beta<-1/ajust$scale
#Weibull coefficients
coef<-cbind(beta,alpha)
#MTTF
mttf<-coef[2]*(gamma((1+(1/coef[1]))))
#Data from variance-covariance matrix:
vcov(ajust)
a=ajust$var[2,2]*ajust$scale^2
b=ajust$var[1,2]*ajust$scale
matriz=matrix(c(ajust$var[1,1],b,b,a),ncol=2,nrow=2)
#MTTF variance - delta method
var_mttf=matriz[2,2]*(gamma(1+1/coef[1]))^2+
2*matriz[1,2]*((-coef[2]/(coef[1]^2))*gamma(1+1/coef[1])*digamma(1+1/coef[1]))+
matriz[1,1]*((-coef[2]/(coef[1]^2))*gamma(1+1/coef[1])*digamma(1+1/coef[1]))^2
#standard error - MTTF
se_mttf=sqrt(var_mttf)
#MTTF confidence intervall (95% confidence)
upper=mttf+1.960*sqrt(var_mttf)
lower=mttf-1.960*sqrt(var_mttf)
因此,从我获取这些数据的论文中得出的结果是:
MTTF standard error = 0.47
MTTF upper = 2.98
MTTF lower = 1.15
这与我的代码的结果相去甚远。
但是论文中的alpha、delta 和 MTTF 与我的代码具有相同的值:
alpha = 2.273151
delta = 1.417457
MTTF = 2.067864
拜托,我想与你们分享这个困难,你们在 R 方面的经验比我多得多。
此致,维尼修斯。
最佳答案
我建议 beta 需要大于 -1,但根据我自己的计算;贝塔=2。
关于r - MTTF 的置信区间 - R 中的威 bool 生存曲线,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/30260151/
我正在从 Stata 迁移到 R(plm 包),以便进行面板模型计量经济学。在 Stata 中,面板模型(例如随机效应)通常报告组内、组间和整体 R 平方。 I have found plm 随机效应
关闭。这个问题不符合Stack Overflow guidelines .它目前不接受答案。 想改进这个问题?将问题更新为 on-topic对于堆栈溢出。 6年前关闭。 Improve this qu
我想要求用户输入整数值列表。用户可以输入单个值或一组多个值,如 1 2 3(spcae 或逗号分隔)然后使用输入的数据进行进一步计算。 我正在使用下面的代码 EXP <- as.integer(rea
当 R 使用分类变量执行回归时,它实际上是虚拟编码。也就是说,省略了一个级别作为基础或引用,并且回归公式包括所有其他级别的虚拟变量。但是,R 选择了哪一个作为引用,以及我如何影响这个选择? 具有四个级
这个问题基本上是我之前问过的问题的延伸:How to only print (adjusted) R-squared of regression model? 我想建立一个线性回归模型来预测具有 15
我在一台安装了多个软件包的 Linux 计算机上安装了 R。现在我正在另一台 Linux 计算机上设置 R。从他们的存储库安装 R 很容易,但我将不得不使用 安装许多包 install.package
我正在阅读 Hadley 的高级 R 编程,当它讨论字符的内存大小时,它说: R has a global string pool. This means that each unique strin
我们可以将 Shiny 代码写在两个单独的文件中,"ui.R"和 "server.R" , 或者我们可以将两个模块写入一个文件 "app.R"并调用函数shinyApp() 这两种方法中的任何一种在性
我正在使用 R 通过 RGP 包进行遗传编程。环境创造了解决问题的功能。我想将这些函数保存在它们自己的 .R 源文件中。我这辈子都想不通怎么办。我尝试过的一种方法是: bf_str = print(b
假设我创建了一个函数“function.r”,在编辑该函数后我必须通过 source('function.r') 重新加载到我的全局环境中。无论如何,每次我进行编辑时,我是否可以避免将其重新加载到我的
例如,test.R 是一个单行文件: $ cat test.R # print('Hello, world!') 我们可以通过Rscript test.R 或R CMD BATCH test.R 来
我知道我可以使用 Rmd 来构建包插图,但想知道是否可以更具体地使用 R Notebooks 来制作包插图。如果是这样,我需要将 R Notebooks 编写为包小插图有什么不同吗?我正在使用最新版本
我正在考虑使用 R 包的共享库进行 R 的站点安装。 多台计算机将访问该库,以便每个人共享相同的设置。 问题是我注意到有时您无法更新包,因为另一个 R 实例正在锁定库。我不能要求每个人都关闭它的 R
我知道如何从命令行启动 R 并执行表达式(例如, R -e 'print("hello")' )或从文件中获取输入(例如, R -f filename.r )。但是,在这两种情况下,R 都会运行文件中
我正在尝试使我当前的项目可重现,因此我正在创建一个主文档(最终是一个 .rmd 文件),用于调用和执行其他几个文档。这样我自己和其他调查员只需要打开和运行一个文件。 当前设置分为三层:主文件、2 个读
关闭。这个问题不符合Stack Overflow guidelines .它目前不接受答案。 想改进这个问题?将问题更新为 on-topic对于堆栈溢出。 5年前关闭。 Improve this qu
我的 R 包中有以下描述文件 Package: blah Title: What the Package Does (one line, title case) Version: 0.0.0.9000
有没有办法更有效地编写以下语句?accel 是一个数据框。 accel[[2]]<- accel[[2]]-weighted.mean(accel[[2]]) accel[[3]]<- accel[[
例如,在尝试安装 R 包时 curl作为 usethis 的依赖项: * installing *source* package ‘curl’ ... ** package ‘curl’ succes
我想将一些软件作为一个包共享,但我的一些脚本似乎并不能很自然地作为函数运行。例如,考虑以下代码块,其中“raw.df”是一个包含离散和连续类型变量的数据框。函数“count.unique”和“squa
我是一名优秀的程序员,十分优秀!