r - 使用固定纵横比保存时左对齐 ggplot

Question

我正在构建一个自定义 ggplot 主题，以标准化我生成的图表的外观和感觉。目标比这个最小的例子更复杂，所以我正在寻找一个通用的解决方案。我有几个主要目标:

• 我希望所有图表都以相同的大小导出(3000 像素宽，1500 像素高)。
• 我想控制绘图面板本身的纵横比。
• 我想使用 textGrobs 来包含图形编号。
• 我希望图片左对齐

我面临的挑战是，当结合这两个约束时，保存的图像将窗口内的 ggplot 图居中，这作为默认设置是有意义的，但在这种情况下看起来很糟糕。

我希望有一个通用的解决方案可以在我导出时左对齐 ggplot 面板。理想情况下，这也适用于多面图。

似乎使用 gridExtra、gtable、cowplot 和 egg 包中的一个或一些组合应该可以实现某些东西，但是在试验了几个小时之后我有点不知所措。有人知道我该怎么做吗？我的代码包含在下面。

这是生成的图像。如您所见，标题在底部左对齐，但 ggplot 本身水平居中。我也希望 ggplot 图左对齐。

图表输出:/image/5EM2c.png

library(ggplot2)

# Generate dummy data
x <- paste0("var", seq(1,10))
y <- LETTERS[1:10]
data <- expand.grid(X=x, Y=y)
data$Z <- runif(100, -2, 2)

# Generate heatmap with fixed aspect ratio
p1 <- ggplot(data, aes(X, Y, fill= Z)) + 
    geom_tile() +
    labs(title = 'A Heatmap Graph') +
    theme(aspect.ratio = 1)


# A text grob for the footer
figure_number_grob <- grid::textGrob('Figure 10',
                                     x = 0.004,
                                     hjust = 0,
                                     gp = grid::gpar(fontsize = 10,
                                                     col = '#01A184'))

plot_grid <- ggpubr::ggarrange(p1,
                               figure_number_grob,
                               ncol = 1,
                               nrow = 2,
                               heights = c(1,
                                           0.05))

# save it
png(filename = '~/test.png', width = 3000, height = 1500, res = 300, type = 'cairo')
print(plot_grid)
dev.off()

Answer 1

我能够找到满足我需求的解决方案，尽管它确实感觉有点老套。

核心思想:

• 生成没有固定宽高比的绘图。
• 将图中的图例拆分为自己的组件
• 使用 GridExtra 的 arrangeGrob 水平组合绘图、间隔符、图例和另一个间隔符
• 将地 block 的宽度设置为 npc 的一部分(正常父坐标)，在本例中为 0.5。这意味着绘图将占据输出文件水平空间的 50%。
  • 请注意，这与为绘图设置固定纵横比并不完全相同。如果您知道输出文件的大小，它接近是同一件事，但是轴文本和轴标题的大小会影响面板本身的输出纵横比，所以当它让您接近时, 如果你需要一个真正固定的长宽比，那就不理想了
• 将间隔器的宽度设置为 npc 的剩余部分(在本例中，再次为 0.5)，减去图例的宽度以使图例在剩余空间中水平居中。

这是我的代码:

library(ggplot2)

# Generate dummy data
x <- paste0("var", seq(1,10))
y <- LETTERS[1:10]
data <- expand.grid(X=x, Y=y)
data$Z <- runif(100, -2, 2)

# Generate heatmap WITHOUT fixed aspect ratio. I address this below
p1 <- ggplot(data, aes(X, Y, fill= Z)) + 
    geom_tile() +
    labs(title = 'A Heatmap Graph')

# Extract the legend from our plot
legend = gtable::gtable_filter(ggplotGrob(p1), "guide-box")


plot_output <- gridExtra::arrangeGrob(
    p1 + theme(legend.position="none"),                           # Remove legend from base plot
    grid::rectGrob(gp=grid::gpar(col=NA)),                        # Add a spacer
    legend,                                                       # Add the legend back
    grid::rectGrob(gp=grid::gpar(col=NA)),                        # Add a spacer
    nrow=1,                                                       # Format plots in 1 row
    widths=grid::unit.c(unit(0.5, "npc"),                         # Plot takes up half of width
                        (unit(0.5, "npc") - legend$width) * 0.5,  # Spacer width
                        legend$width,                             # Legend width
                        (unit(0.5, "npc") - legend$width) * 0.5)) # Spacer width

# A text grob for the footer
figure_number_grob <- grid::textGrob('Figure 10',
                                     x = 0.004,
                                     hjust = 0,
                                     gp = grid::gpar(fontsize = 10,
                                                     col = '#01A184'))

plot_grid <- ggpubr::ggarrange(plot_output,
                               figure_number_grob,
                               ncol = 1,
                               nrow = 2,
                               heights = c(1,
                                           0.05))

# save it
png(filename = '~/test.png', width = 3000, height = 1500, res = 300, type = 'cairo')
print(plot_grid)
dev.off()

这是输出图像:/image/rgzFy.png