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r - Tidyverse 命令已弃用 : T test inside a summarise , 然后报告所有结果

转载 作者:行者123 更新时间:2023-12-05 06:24:16 24 4
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我几乎每天都使用 tidyverse(及其环境),有时我不得不回到以前的/旧的分析。不幸的是,跟踪对包所做的更改并不容易。

这个脚本非常实用,它执行我想要的(它在函数内部与其他命令一起使用)

ds <- data.frame(result = rnorm(100,5,2),
time = c("1","2"))
library(tidyverse)
library(broom)

ds %>%
summarise_at(vars("result"),
funs(list(tidy(t.test(. ~ time, paired=TRUE))))) %>% map(1)

我知道这不是最优雅的语法。现在,此消息出现在命令之后:

funs() 从 dplyr 0.8.0 开始被软弃用请使用函数或 lambda 的列表:

  # Simple named list: 
list(mean = mean, median = median)

# Auto named with `tibble::lst()`:
tibble::lst(mean, median)

# Using lambdas
list(~ mean(., trim = .2), ~ median(., na.rm = TRUE))

我所有修复它的尝试都给了我一个信息...

> ds %>% 
+ summarise_at(vars("result"),
+ lst(tidy(t.test(. ~ time, paired=TRUE)))) %>% map(1)
Error in model.frame.default(formula = . ~ time) :
invalid type (list) for variable '.'
> ds %>%
+ summarise_at(vars("result"),
+ list(list(tidy(t.test(. ~ time, paired=TRUE))))) %>% map(1)
Error in model.frame.default(formula = . ~ time) :
invalid type (list) for variable '.'
> ds %>%
+ summarise_at(vars("result"),
+ list(list(tidy(~ t.test(. ~ time, paired=TRUE))))) %>% map(1)
Error: No tidy method for objects of class formula

所以..第一个问题:有什么关于修复它的线索吗?
第二:我可以在哪里关注这些(持续)更新?
:我使用tidyverse是因为我喜欢它处理命令的方式。它非常直观,但我认为这是一个重要的副作用,它不断变化......我是否应该尝试将我的所有例程移至 R base(可能 R base 不会改变其功能......)?

谢谢大家。

最佳答案

这个怎么样?

ds <- data.frame(result = rnorm(100,5,2),
time = c("1","2"))

library(tidyverse)
library(broom)

ds %>%
summarise_at(vars("result"),
list(~ list(tidy(t.test(. ~ time, paired=TRUE))))) %>% map(1)
#> $result
#> # A tibble: 1 x 8
#> estimate statistic p.value parameter conf.low conf.high method
#> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <chr>
#> 1 -0.719 -1.77 0.0823 49 -1.53 0.0955 Paire~
#> # ... with 1 more variable: alternative <chr>

reprex package 创建于 2019-09-04 (v0.3.0)

关于r - Tidyverse 命令已弃用 : T test inside a summarise , 然后报告所有结果,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/57796011/

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