containers - 构建后编辑奇点 .sif 容器的运行脚本

Question

我构建了一个奇点容器并将其上传到我的 HPC 服务。

有没有办法在不重建整个容器的情况下更改 .sif 文件的运行脚本？我在服务上有一个 shell。

根据我对奇点的理解，这应该是可能的，但我不知道如何实现。

Answer 1

您可以将 SIF 文件转换为(可写的)沙箱，它确实是一个目录:

sudo singularity build --sandbox <SANDBOX> <CONTAINER>.sif

然后您可以“进入”沙箱并在那里修改内容(注意 --writable 标志和需要 sudo ):

sudo singularity shell --writable <SANDBOX>

或者您可以编辑<SANDBOX>/singularity或 <SANDBOX>/environment正如昆汀所建议的那样。

额外的好东西可以在 <SANDBOX>/.singularity.d 中找到目录。如 Singularity文件，它是构建容器的配方。

一旦您对更改感到满意，您就可以将沙箱转换回(新的)SIF 文件:

sudo singularity build <NEW_CONTAINER>.sif <SANDBOX>