geometry - 如何计算附加路径长度(APL)图像分割指标？

Question

背景

我正在尝试计算在放射治疗计划的分段分割中使用的附加路径长度 (APL) 指标。该指标起源于 this paper但我找不到任何关于如何计算它的解释，只有下图表示形状 A(黑色)，以及创建形状 B 所需的表面编辑(黄色虚线):

added path length

目前我是 calculating this metric通过将所有形状 B 但不在形状 A 的表面像素相加(类似于 this )并乘以像素宽度(假设等距像素)以获得以毫米为单位的值。我还添加了一个公差参数，允许形状 A 和 B 的表面在将表面视为“已编辑”之前存在一些偏差。

问题

1. 关于原始作者如何计算此指标的任何好的引用资料？
2. 对于从体素到 mm 版本的这个指标有什么想法吗？

Answer 1

我遇到了同样的问题，并在 platipy 中实现了一个 APL 指标版本。代码可用 here .这是开源 Python 代码。

$ pip install platipy

(注意 - 如果出现错误，您可能必须使用 pip install -U pip 更新 pip)。

from platipy.imaging.label.comparison import compute_metric_total_apl

compute_metric_total_apl(label_A, label_B, distance_threshold=3)

这将返回以毫米为单位的(总)APL。您可能还会发现 compute_metric_mean_apl 函数很有用，它可以计算切片平均 APL。

您可能会注意到添加的变量 distance_threshold。如果两个轮廓比这个距离更近，则它们被认为是相同的。它用于使 APL 对 真实 差异更敏感(即忽略可忽略的体素尺度变化)。只需将其设置为零即可获得原始定义的 APL。