perl - 将 OWL 本体转换为 OBO

Question

我需要将 OWL 本体转换为 OBO。

我试过这个工具 https://github.com/ontodev/robot/但输出格式根本不正确，只是一些部分。

还有 OBO-EDIT2 和 Protegé，但它们无法进行转换。

最后我尝试了这个 Perl 模块 http://search.cpan.org/~easr/但是它给出了这个错误

未定义的子例程 &XML::Parser 在/usr/local/share/perl/5.14.2/OBO/Parser/OWLParser.pm 第 146 行调用。

并且尝试安装 XML::Parser 总是以错误结束。

谁能帮我转换本体？

Answer 1

你试过了吗https://github.com/owlcollab/owltools/ ？

And trying to install XML::Parser always ends with an error.

您正在运行什么命令来安装 XML::Parser？那是什么错误？您可以使用相同的命令安装其他 perl 模块吗？那些需要 make 的呢？