- html - 出于某种原因,IE8 对我的 Sass 文件中继承的 html5 CSS 不友好?
- JMeter 在响应断言中使用 span 标签的问题
- html - 在 :hover and :active? 上具有不同效果的 CSS 动画
- html - 相对于居中的 html 内容固定的 CSS 重复背景?
目前,我在 python 中使用 skimage 从一些二值化 map 中提取开放空间的骨架,如下图所示,
使用以下 python 代码:
from skimage.morphology import skeletonize
from skimage import draw
from skimage.io import imread, imshow
from skimage.color import rgb2gray
# load image from file
img_fname=os.path.join('images','mall1_2F_schema.png')
image=imread(img_fname)
# Change RGB color to gray
image=rgb2gray(image)
# Change gray image to binary
image=np.where(image>np.mean(image),1.0,0.0)
# perform skeletonization
skeleton = skeletonize(image)
现在我想从骨架中提取端点和交叉点作为 Networkx 图形对象的节点,同时计算相邻节点之间的距离作为 Networkx 图形对象的边。目前,我必须手动获取点坐标并将其输入到 NetworkX 对象初始化过程中,我们有没有更智能的方法来自动完成所有操作?
对了,我找到了yaron kahanovitch对 the question on stackoverflow 的回答提出了类似的方法。但是,没有给出更多的实现建议,我认为 NetworkX 可能是一种方法。
非常感谢您的任何建议。
最佳答案
给你。
这段代码是针对2D骨架图像的,您可以轻松地将其扩展到3D。
import networkx as nx
import numpy as np
def skeleton_image_to_graph(skeIm, connectivity=2):
assert(len(skeIm.shape) == 2)
skeImPos = np.stack(np.where(skeIm))
skeImPosIm = np.zeros_like(skeIm, dtype=np.int)
skeImPosIm[skeImPos[0], skeImPos[1]] = np.arange(0, skeImPos.shape[1])
g = nx.Graph()
if connectivity == 1:
neigh = np.array([[0, 1], [0, -1], [1, 0], [-1, 0]])
elif connectivity == 2:
neigh = np.array([[0, 1], [0, -1], [1, 0], [-1, 0], [1, 1], [1, -1], [-1, 1], [-1, -1]])
else:
raise ValueError(f'unsupported connectivity {connectivity}')
for idx in range(skeImPos[0].shape[0]):
for neighIdx in range(neigh.shape[0]):
curNeighPos = skeImPos[:, idx] + neigh[neighIdx]
if np.any(curNeighPos<0) or np.any(curNeighPos>=skeIm.shape):
continue
if skeIm[curNeighPos[0], curNeighPos[1]] > 0:
g.add_edge(skeImPosIm[skeImPos[0, idx], skeImPos[1, idx]], skeImPosIm[curNeighPos[0], curNeighPos[1]], weight=np.linalg.norm(neigh[neighIdx]))
g.graph['physicalPos'] = skeImPos.T
return g
关于python - 如何提取 skimage 骨架信息到 python 中的 NetworkX 节点和边以进行进一步的高级分析,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/41008973/
我正在尝试对网络上的投票动态进行建模,并希望能够在 NetworkX 中创建一个图表,在其中我可以在节点上迭代投票过程,让它们的颜色变化对应于它们的投票“标签”。 我已设法获得此代码以查看每个节点的属
我无法计算简单 NetworkX 加权图的中心性。 这是正常的还是我做错了什么? 我使用简单的 add_edge(c[0],c[1],weight = my_values) 添加边,其中c[0],c[
我想在函数调用 d(n) 之前比较 networkx.Graph 对象 n 的状态(有副作用)之后与国家合作。 有一些可变的对象节点属性,例如 n.node[0]['attribute'],我想对其进
我正在使用 NetworkX 生成一些噪声数据的图表。我想通过删除虚假分支来“清理”图表,并希望避免重新发明轮子。 例如,链接的图片显示了一组示例图形,作为由灰线连接的彩色节点。我想修剪白框指示的节点
我目前正在尝试制定一种算法来在图中查找派系,幸运的是我从 Networkx 找到了一个函数的文档,该函数就是这样做的。不幸的是,变量名有点简洁,我很难理解代码的每一部分的作用。 这里是 find_cl
我正在尝试使用 NetworkX 在两个节点之间添加平行边,但由于以下错误而失败。我究竟做错了什么? import networkx as nx import graphviz g1 = nx.Mul
我希望将 Pajek 数据集转换为 networkx Graph()。数据集来自哥斯达黎加Family Ties 。我正在使用非常方便的 networkx.read_pajek(pathname) 函
我在networkx中有一个巨大的图,我想从每个节点获取深度为2的所有子图。有没有一种好的方法可以使用networkx中的内置函数来做到这一点? 最佳答案 正如我在评论中所说,networkx.ego
我希望将 Pajek 数据集转换为 networkx Graph()。数据集来自哥斯达黎加Family Ties 。我正在使用非常方便的 networkx.read_pajek(pathname) 函
我在使用以下代码时遇到问题。边连接节点。但是是否有可能有一个定向网络,如果一个“人”跟随一个“人”,但它只是一种方式,在边缘有箭头或方向。 plt.figure(figsize=(12, 12)) #
我正在 Windows 机器上使用 Python 3,尽管付出了很多努力,但仍未能安装 pygraphviz。单独讨论。 我有networkx和graphviz模块...是否有一个范例可以在netwo
我正在使用《Python 自然语言处理》一书(“www.nltk.org/book”)自学 Python 和 NLTK。 我在 NetworkX 上被困在第 4 章第 4 部分第 8 部分。当我尝试运
下面是我的代码: import networkx as nx for i in range(2): G = nx.DiGraph() if i==0: G.add_ed
我正在使用 deap 符号回归示例问题中的这段代码,图形显示正常,但我希望节点扩展为圆角矩形以适合文本 自动 . (我不想只是通过反复试验来指定节点大小)。我该怎么做? # show tree imp
我正在尝试使用 networkx 读取 gml 文件(很简单吧?),除非我尝试读取文件时出现错误“networkx.exception.NetworkXError: cannot tokenize u
如何按厚度在networkx中绘制N> 1000个节点的加权网络?如果我有一个源、目标节点和每个边的权重的 .csv 列表,我正在考虑使用该方法: for i in range(N) G.add_ed
我希望 networkx 在我的定向中找到绝对最长的路径, 无环图。 我知道 Bellman-Ford,所以我否定了我的图长度。问题: networkx 的 bellman_ford() 需要一个源节
我在图中有一个节点,它充当一种“临时连接器”节点。我想删除该节点并更新图中的边,以便其所有直接前辈都指向其直接后继者。 在 networkx 中是否有内置功能可以做到这一点,还是我需要推出自己的解决方
我有两张彩色图表。我想确定它们是否同构,条件是同构必须保留顶点颜色。 networkx 中是否有算法可以做到这一点? 这些图是无向且简单的。 最佳答案 检查documentation对于is_isom
我有一组起点-终点坐标,我想计算它们之间的最短路径。 我的起点-终点坐标有时位于一条长直线道路的中间。但是,OSMnx/networkx 计算的最短路径不会考虑中间边到最近节点的路径。 OSMnx 或
我是一名优秀的程序员,十分优秀!