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有以下我要解析的字符串:
((K00134,K00150) K00927,K11389) (K00234,K00235)
每个步骤由空格分隔,交替由逗号表示。我被困在字符串的第一部分,括号内有一个空格。我正在寻找的所需输出是:
[[['K00134', 'K00150'], 'K00927'], 'K11389'], ['K00234', 'K00235']
到目前为止我得到的是进行递归解析的基本设置,但我对如何将空格分隔列表中的代码编码到括号表达式中感到困惑
from pyparsing import Word, Literal, Combine, nums, \
Suppress, delimitedList, Group, Forward, ZeroOrMore
ortholog = Combine(Literal('K') + Word(nums, exact=5))
exp = Forward()
ortholog_group = Suppress('(') + Group(delimitedList(ortholog)) + Suppress(')')
atom = ortholog | ortholog_group | Group(Suppress('(') + exp + Suppress(')'))
exp <<= atom + ZeroOrMore(exp)
最佳答案
你走在正确的轨道上,但我认为你只需要一个地方用 () 进行分组,而不是两个。
import pyparsing as pp
LPAR,RPAR = map(pp.Suppress, "()")
ortholog = pp.Combine('K' + pp.Word(pp.nums, exact=5))
ortholog_group = pp.Forward()
ortholog_group <<= pp.Group(LPAR + pp.OneOrMore(ortholog_group | pp.delimitedList(ortholog)) + RPAR)
expr = pp.OneOrMore(ortholog_group)
tests = """\
((K00134,K00150) K00927,K11389) (K00234,K00235)
"""
expr.runTests(tests)
给出:
((K00134,K00150) K00927,K11389) (K00234,K00235)
[[['K00134', 'K00150'], 'K00927', 'K11389'], ['K00234', 'K00235']]
[0]:
[['K00134', 'K00150'], 'K00927', 'K11389']
[0]:
['K00134', 'K00150']
[1]:
K00927
[2]:
K11389
[1]:
['K00234', 'K00235']
这与您所说的不完全相同:
you wanted: [[['K00134', 'K00150'], 'K00927'], 'K11389'], ['K00234', 'K00235']
I output : [[['K00134', 'K00150'], 'K00927', 'K11389'], ['K00234', 'K00235']]
我不确定为什么在您想要的输出中围绕空格分隔的部分 (K00134,K00150) K00927
进行分组。这是你的意图还是打字错误?如果有意,您需要修改 ortholog_group
的定义,除了在 parens 处分组之外,它还会做一个以空格分隔的组的分隔列表。我能得到的最接近的是:
[[[[['K00134', 'K00150']], 'K00927'], ['K11389']], [['K00234', 'K00235']]]
这需要一些恶作剧在空间上分组,但在与其他组分组时不对裸直向同源分组。这是它的样子:
ortholog_group <<= pp.Group(LPAR + pp.delimitedList(pp.Group(ortholog_group*(1,) & ortholog*(0,))) + RPAR) | pp.delimitedList(ortholog)
&
运算符与重复运算符组合给出了以空格分隔的分组(*(1,)
等同于 OneOrMore
, *(0,)
和 ZeroOrMore
,但也支持 *(10,)
表示“10 或更多”,或 *( 3,5)
表示“至少 3 且不超过 5”)。这也不完全符合您的要求,但如果您确实需要对以空格分隔的位进行分组,则可能会让您更接近。
但我必须说,按空格分组是模棱两可的——或者至少是令人困惑的。 “(A,B) C D”应该是 [[A,B],C,D]
或 [[A,B],C],[D]
或[[A,B],[C,D]]
?我认为,如果可能的话,您应该允许使用逗号分隔的列表,并且也许也允许使用空格分隔,但是在应该对项目进行分组时需要 ()。
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