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当我运行 nextflow 时,我得到一个 .nextflow
文件夹,但我找不到更改其位置的方法(即它不是 -work-dir
).如何更改 .nextflow
文件夹的位置?
我看过 launchDir
但它似乎是一个只读的隐式变量,不能在 CLI 中被覆盖,而且 --launchDir
选项只是适用于 k8s 范围(请参阅 gitter 中的原始聊天)
我使用的是 Nextflow 20.10.0 build 5430。
最佳答案
保持事物整洁是令人钦佩的。来自 this comment ,看起来唯一的方法(不做疯狂的事情...)是更改到您希望 .nextflow
缓存目录存在的目录并指向所有其他选项(即 -work -dir
, -log
等)到一个单独的目录:
If you want
.nextflow
in dir A and the pipeline work dir in B:cd A
nextflow run -w BThe
.nextflow
has to be in the launchingdirectory to properly maintain the history of the executions.
关于nextflow - 更改 .nextflow 文件夹的位置?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/70083511/
当我运行 nextflow 时,我得到一个 .nextflow 文件夹,但我找不到更改其位置的方法(即它不是 -work-dir).如何更改 .nextflow 文件夹的位置? 我看过 launchD
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