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nextflow - 更改 .nextflow 文件夹的位置?

转载 作者:行者123 更新时间:2023-12-05 04:41:27 25 4
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当我运行 nextflow 时,我得到一个 .nextflow 文件夹,但我找不到更改其位置的方法(即它不是 -work-dir).如何更改 .nextflow 文件夹的位置?

我看过 launchDir 但它似乎是一个只读的隐式变量,不能在 CLI 中被覆盖,而且 --launchDir 选项只是适用于 k8s 范围(请参阅 gitter 中的原始聊天)

我使用的是 Nextflow 20.10.0 build 5430。

最佳答案

保持事物整洁是令人钦佩的。来自 this comment ,看起来唯一的方法(不做疯狂的事情...)是更改到您希望 .nextflow 缓存目录存在的目录并指向所有其他选项(即 -work -dir, -log 等)到一个单独的目录:

If you want .nextflow in dir A and the pipeline work dir in B:

cd A
nextflow run -w B

The .nextflow has to be in the launchingdirectory to properly maintain the history of the executions.

关于nextflow - 更改 .nextflow 文件夹的位置?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/70083511/

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