r - 如何隐藏(或删除)箱线图中的点？

Question

我有一个关于如何隐藏(或删除)箱线图中的点的问题。

这是我实现的代码。

install.packages("randomForestSRC") 
install.packages("ggRandomForests")

library(randomForestSRC) 
library(ggRandomForests)

data(pbc, package="randomForestSRC") 
pbc.na <- na.omit(pbc)

set.seed(123) 
rsf <- rfsrc(Surv(days,status)~., data=pbc.na, ntree=500, importance=T)

gg_v <- gg_variable(rsf, time = c(2000, 4000),
                    time.labels = c("2000 days", "4000 days"))

gg_v$stage <- as.factor(gg_v$stage)

plot(gg_v, xvar="stage", panel=T, points=F)+
  ggplot2::theme_bw() +
  ggplot2::geom_boxplot(outlier.shape=NA)+
  ggplot2::labs(y="Survival (%)")+
  ggplot2::coord_cartesian(ylim=c(-.01, 1.02)) 

所以我想隐藏(或删除)事件的所有点(假点和真点)。

但是，我没有关于我想要什么的信息。

请告诉我怎么做。

永远感谢。

Answer 1

我不熟悉 ggRandomForests 的工作原理。但是使用数据框 gg_v，我们可以直接在 ggplot2 中进行绘图。

ggplot(gg_v, aes(stage, yhat, group = stage)) + 
  geom_boxplot(outlier.shape = NA) + 
  facet_wrap(~time, nrow = 2, strip.position = "right") + 
  ylab("Survival (%)") + 
  theme_bw()