scikit-learn - 为 scikit-learn 运行 setup.py install ... 错误

Question

我正在使用 MacOs Mojave，目前正在尝试运行 GitHub 上可用的项目 this关联。我已经安装了最新版本的 python(即 python 3.8)，目前在安装要求时遇到问题，主要是在 scikit-learn 中。无论哪种方式，我都会遇到同样的错误。

请帮助我在本地机器上完全运行这个项目。

我还在 GitHub 主页上提出了一个与此相关的问题，仍在等待充分的回应。

当我尝试根据给定的说明和 stackoverflow 上的可用答案安装 cython 时，我使用命令 pip3 install --upgrade cython 收到另一个带有 python3.8 的大错误页面，如答案中所述。我在此处附上错误消息。 这是我之后得到的完整错误集。如果有人能用 python3.8 帮助我完成这个项目，请提前致谢

感谢 VonC 解决了 cython 的安装问题。现在，在我的系统中使用 python3.8 安装 scikit-learn 时遇到的另一个错误是: scikit-learn installation error with python3.8正如@VonC 的回答，我确实尝试访问链接 enter link description here现在在执行命令时 pip install --verbose --editable 我现在得到 请帮我解决这个问题。我已经使用 Homebrew 安装了 LLVM OpenMP 库

Answer 1

“没有名为 Cython 的模块”在其他项目中出现:CellProfiler/centrosome issue 78有各种解决方法:

python3 setup.py install
# and/or
python3.6 -m pip install --upgrade cython
sudo python3.6 -m pip install --upgrade cython
# and/or
pip install --upgrade cython

If you're using python 2.7 or above, type on terminal: pip install --upgrade cython
This should work.
The error is probably because the cython version installed from pip is incompatible to the python version on your system.

如果这导致:

xcrun: error: invalid active developer path (/Library/Developer/CommandLineTools)

然后检查this question ，并尝试更新 XCode:xcode-select --install

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关于 scikit-learn错误，它是:

It seems that scikit-learn cannot be built with OpenMP support.

• Make sure you have followed the installation instructions:

https://scikit-learn.org/dev/developers/advanced_installation.html

有一个issue about this error

Looks like it's the result of an error in sklearn/_build_utils/openmp_helpers.py
For me the test program ./test_openmp.c works as expected, but not in the building Scikit-learn process.

So, I just replace False to True in the line 111 in openmp_helpers.py (sed -i -e '111s/False/True/' e.g.).
As a result, I get normal building of Scikit-learn 0.21.3

而且，from instructions for Mac :

install libomp with Homebrew to extend the default Apple clang compiler.

I tried the second option to install libomp with Homebrew.
It worked like a charm.

如果您看到“未找到文件“setup.py””，则表示未在正确的文件夹中执行 pip 命令。
如果你是installing from sources ，您应该键入 pip install --verbose --editable .(在 conda activate sklearn-dev 之后)您克隆了所述源的位置(您应该在其中看到 setup.py)