r - 用来自另一个数据框的数据改变数据框

Question

可重现数据:

df1 <- tibble(id = c("GR1","GR2"),
              area = c("A1","A2"),
              date1 = as.Date(c("2022-01-01","2022-01-02")),
              date2 = as.Date(c("2022-01-06","2022-01-08")))

set.seed(543)
df2 <- tibble(date3 = seq(as.Date("2022-01-01"), as.Date("2022-01-09"), "days"),
              temperature =runif(9, min = 28, max = 33),
              area = c("A1","A2","A1","A2","A1","A2","A1","A2","A1"))

您好，我想在 df1 中创建一个列，其中的平均温度导致来自 df2 的过滤器。 (在真实数据框中，我在 df1 中有 1036 行，在 df2 中有 26192 行。)

我试过这个方法，但是没有像我想的那样起作用

df3 <- df1 %>%
  group_by(area) %>%
  mutate(average_temp = mean(filter(.data = df2, date3 >= df1$date1 & date3 <= df1$date2 & area == df1$area)$temperature))

我收到这个错误

警告信息:

1:计算 average_temp = mean(...) 时出现问题。

我较长的物体长度不是较短物体长度的倍数

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预期的结果是

<表类="s-表"><头>编号区域日期 1日期 2平均温度<正文>GR1A12022-01-012022-02-1231.58708GR2A22022-01-022022-02-1130.50867

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这段代码本身给出了预期的结果。所以问题一定是我在使用 mutate 和 dplyr 语法逻辑的行迭代中没有看到的东西。

mean(filter(.data = df2, date3 >= df1$date1[2] & date3 <= df1$date2[2] & area == df1$area[2])$temperature)

Answer 1

这是一个非相等或基于范围的连接。不幸的是，dplyr 本身不能做到这一点，所以我们需要另一个包的帮助。以下选项:

模糊连接

fuzzyjoin::fuzzy_left_join(
  df1, df2,
  by = c("area", date1="date3", date2="date3"),
  match_fun=list(`==`, `<=`, `>=`)
) %>%
  group_by(id, date1, date2) %>%
  summarize(
    area = area.x[1],
    avg = mean(temperature)
  ) %>%
  ungroup()
# `summarise()` has grouped output by 'id', 'date1'. You can override using the `.groups` argument.
# # A tibble: 2 x 5
#   id    date1      date2      area    avg
#   <chr> <date>     <date>     <chr> <dbl>
# 1 GR1   2022-01-01 2022-01-06 A1     31.6
# 2 GR2   2022-01-02 2022-01-08 A2     30.5

数据表

library(data.table)
DT1 <- as.data.table(df1)
DT2 <- as.data.table(df2)
DT1[DT2, avg := ave(i.temperature, id, FUN = mean),
    on = .(area, date1 <= date3, date2 >= date3) ]
#        id   area      date1      date2      avg
#    <char> <char>     <Date>     <Date>    <num>
# 1:    GR1     A1 2022-01-01 2022-01-06 31.58708
# 2:    GR2     A2 2022-01-02 2022-01-08 30.50867

(我知道没有ave有更规范的方法来做到这一点，但我没时间了......)

sqldf

# library(sqldf) # not required to load, per se
sqldf::sqldf(
  "select df1.id, df1.area, df1.date1, df1.date2,
     avg(df2.temperature) as avg
   from df1
     left join df2 on df1.area=df2.area
       and df2.date3 between df1.date1 and df1.date2
   group by df1.id, df1.area, df1.date1, df1.date2")
#    id area      date1      date2      avg
# 1 GR1   A1 2022-01-01 2022-01-06 31.58708
# 2 GR2   A2 2022-01-02 2022-01-08 30.50867