python - 计算 pandas DataFrame 中值的频率

Question

拥有这个 pandas.core.frame.DataFrame:

Gorilla     A  T  C  C  A  G  C  T
Dog         G  G  G  C  A  A  C  T
Humano      A  T  G  G  A  T  C  T
Drosophila  A  A  G  C  A  A  C  C
Elefante    T  T  G  G  A  A  C  T
Mono        A  T  G  C  C  A  T  T
Unicornio   A  T  G  G  C  A  C  T

我想要一个这样的数据框:

    A   5 1 0 0 5 5 0 0
    C   0 0 1 4 2 0 6 1
    G   1 1 6 3 0 1 0 0
    T   1 5 0 0 0 1 1 6 

基本上，我想要的是逐列计算频繁出现的列并创建第二个 df，如我所示。

我想这样做是因为最后，我想获得一个共识字符串。应该是这样的 A T G C A A C T

谁能帮助我或给我一些建议？

Answer 1

尝试:

result = df.apply(pd.value_counts).fillna(0)

   col1  col2  col3  col4  col5  col6  col7  col8
A   5.0   1.0   0.0   0.0   5.0   5.0   0.0   0.0
C   0.0   0.0   1.0   4.0   2.0   0.0   6.0   1.0
G   1.0   1.0   6.0   3.0   0.0   1.0   0.0   0.0
T   1.0   5.0   0.0   0.0   0.0   1.0   1.0   6.0