RMarkdown : How to pass arguments to bash chunk defined as variables in R?

Question

Cross-posted

我想使用 R 环境中定义的变量作为 bash block 中的参数。有什么办法吗？

例如，在下面的示例中，我想使用 R 来定义脚本的路径并将其作为参数传递给 bash:

```{r}
path_to_script <- glue("{here::here()}/bash_scripts/script.sh")
\```

```{bash}
bash  **path_to_script**
\```

Answer 1

我认为 knitr bash 引擎不会进行任何替换，但您应该能够写入环境变量，并从 bash 中使用它。

例如，

---
title: "Untitled"
date: "09/12/2021"
output: html_document
---


```{r}
msg <- shQuote("This is a message from R.")
Sys.setenv(R_MESSAGE = msg)
```

```{bash}
echo $R_MESSAGE
```

产生这个输出:

我在阅读@Fravadona 的评论后添加了 shQuote() 调用:这绝对是一个非常好的主意，因为您正在构建的路径可能包含空格或其他特殊字符。