pycharm - 使用 PyCharm 远程运行非 python 脚本

Question

我正在使用 PyCharm 在 SSH 服务器上远程部署和执行 python。但是，我也希望能够以相同的方式直接运行其他文件。例如，我想通过 sbatch“运行”一个“job.run”脚本，将其提交到 HPC 服务器。

我可以看到 PyCharm 为 python 运行以下类型的命令

ssh://username@server:22/home/username/anaconda3/bin/python -u /home/username/project1/main.py

我想要另一个名为“job.run”的文件，运行如下

ssh://username@server:22/home/username/bin/sbatch /home/username/project1/job.run

这感觉应该很简单，但是我找不到任何允许我这样做的选项。

Answer 1

一个选项是按照说明配置特定的解释器 here在第 6 步的对话窗口中确保设置 Interpreter:/usr/bin/bash。然后您应该使用 job.run 为项目设置该解释器文件在 this doc 之后.您可能需要两个具有不同配置文件/解释器的不同项目；一个使用 Python 代码，另一个使用 Slurm 提交脚本。

要将所有内容都保存在同一个项目中，另一种选择是将作业的提交包装在 Python 代码中，或者使用

• os.system("sbatch job.run") 或更通用的 subprocess package
• PySlurm包
• Slurm Rest API ，按照 this answer 中解释的步骤进行操作