r - 在 R 中绘制 dbscan 的结果

Question

非常感谢您的意见、建议或解决方案，谢谢。

我正在使用 fpc R 中的包对一些非常密集的数据(范围 -3、6 之间的 3 组 40,000 点)进行 dbscan 分析。

我找到了一些集群，我只需要绘制重要的集群。问题是我有一个集群(第一个)，其中包含大约 39,000 个点。我需要绘制除这个集群之外的所有其他集群。
dbscan()创建一个特殊的数据类型来存储所有这些集群数据。它不像数据框那样被索引(但也许有一种方法来表示它？)。

我可以使用基本的 plot() 绘制 dbscan 类型的图形。称呼。但是，就像我说的，这将绘制不相关的 39,000 点。

tl;博士:
如何仅绘制 dbscan 的特定集群数据类型？

Answer 1

如果您查看帮助页面 ( ?dbscan )，它会像所有其他页面一样组织成标记为“描述”、“用法”、“参数”、“详细信息”和“值”的部分。值部分描述了函数 dbscan返回。在这种情况下，它只是一个包含几个组件的列表(标准 R 数据类型)。
cluster组件只是一个整数向量，其长度等于数据中的行数，指示每个观察值属于哪个集群。因此，您可以使用此向量对数据进行子集化，以仅提取您想要的那些集群，然后仅绘制这些数据点。

例如，如果我们使用帮助页面中的第一个示例:

set.seed(665544)
n <- 600
x <- cbind(runif(10, 0, 10)+rnorm(n, sd=0.2), runif(10, 0, 10)+rnorm(n,
    sd=0.2))
ds <- dbscan(x, 0.2)

然后我们可以使用结果， ds仅绘制集群 1-3 中的点:

#Plot only clusters 1, 2 and 3
plot(x[ds$cluster %in% 1:3,])