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r - ggplot2 圆形数据的密度

转载 作者:行者123 更新时间:2023-12-04 23:41:28 24 4
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我有一个数据集,其中 x代表一年中的某一天(比如生日),我想创建一个密度图。
此外,由于我有一些分组信息(比如男孩或女孩),我想使用 ggplot2 的功能。制作密度图。

一开始很简单:

require(ggplot2); require(dplyr)
bdays <- data.frame(gender = sample(c('M', 'F'), 100, replace = T), bday = sample(1:365, 100, replace = T))
bdays %>% ggplot(aes(x = bday)) + geom_density(aes(color = factor(gender)))

然而,由于边缘效应,这给出了一个糟糕的估计。
我想应用我可以使用圆坐标的事实,以便 365 + 1 = 1 - 12 月 31 日之后的一天是 1 月 1 日。
我知道 circular package 提供了这个功能,但我没有成功地使用 stat_function() 来实现它。称呼。
使用 ggplot2对我特别有用因为我希望能够使用刻面, aes电话等。

另外,为了澄清起见,我想要看起来像 geom_density 的东西。 -- 我不是在寻找像以下所示的极坐标图: Circular density plot using ggplot2 .

最佳答案

要消除边缘效应,您可以堆叠三个数据副本,创建密度估计,然后仅显示中间数据副本的密度。这将保证密度函数从一个边缘到另一个边缘的“环绕”连续性。

以下是将原始绘图与新版本进行比较的示例。我用过 adjust参数以在两个图之间设置相同的带宽。另请注意,在循环版本中,如果您希望密度加到 1,则需要重新归一化密度:

set.seed(105)
bdays <- data.frame(gender = sample(c('M', 'F'), 100, replace = T), bday = sample(1:365, 100, replace = T))

# Stack three copies of the data, with adjusted values of bday
bdays = bind_rows(bdays, bdays, bdays)
bdays$bday = bdays$bday + rep(c(0,365,365*2),each=100)

# Function to adjust bandwidth of density plot
# Source: http://stackoverflow.com/a/24986121/496488
bw = function(b,x) b/bw.nrd0(x)

# New "circularized" version of plot
bdays %>% ggplot(aes(x = bday)) +
geom_density(aes(color = factor(gender)), adjust=bw(10, bdays$bday[1:100])) +
coord_cartesian(xlim=c(365, 365+365+1), expand=0) +
scale_x_continuous(breaks=seq(366+89, 366+365, 90), labels=seq(366+89, 366+365, 90)-365) +
scale_y_continuous(limits=c(0,0.0016))
ggtitle("Circularized")

# Original plot
ggplot(bdays[1:100,], aes(x = bday)) +
geom_density(aes(color = factor(gender)), adjust=bw(30, bdays$bday[1:100])) +
scale_x_continuous(breaks=seq(90,360,90), expand=c(0,0)) +
ggtitle("Not Circularized")

enter image description here

关于r - ggplot2 圆形数据的密度,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/36266402/

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