performance - 避免在 R 中按行处理 data.frame

Question

我想知道在 R 中避免按行处理的最佳方法是什么，大多数按行处理的内容都是在内部 C 例程中完成的。例如:我有一个数据框 a :

  chromosome_name start_position end_position strand
1              15       35574797     35575181      1
2              15       35590448     35591641     -1
3              15       35688422     35688645      1
4              13       75402690     75404217      1
5              15       35692892     35693969      1

我想要的是:基于链是正还是负， startOFgene如 start_position或 end_position .避免的一种方法 for循环将用 +1 链和 -1 链分离 data.frame 并执行选择。还有什么其他方法可以加快速度？如果每行有某些其他复杂的处理，则该方法不会扩大规模。

Answer 1

也许这已经足够快了......

transform(a, startOFgene = ifelse(strand == 1, start_position, end_position))


  chromosome_name start_position end_position strand startOFgene
1              15       35574797     35575181      1    35574797
2              15       35590448     35591641     -1    35591641
3              15       35688422     35688645      1    35688422
4              13       75402690     75404217      1    75402690
5              15       35692892     35693969      1    35692892