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df library(sqldf) > sqldf("Se-6ren">
我想将我的数据框( 编辑: 以 CPU 高效的方式)减少到具有 c3、c4 对唯一值的行,同时保留所有列。换句话说,我想转换我的数据框
> df <- data.frame(c1=seq(7), c2=seq(4, 10), c3=c("A", "B", "B", "C", "B", "A", "A"), c4=c(1, 2, 3, 3, 2, 2, 1))
c1 c2 c3 c4
1 1 4 A 1
2 2 5 B 2
3 3 6 B 3
4 4 7 C 3
5 5 8 B 2
6 6 9 A 2
7 7 10 A 1
到数据框
c1 c2 c3 c4
1 1 4 A 1
2 2 5 B 2
3 3 6 B 3
4 4 7 C 3
6 6 9 A 2
其中 c1 和 c2 的值可以是出现在唯一对 c3、c4 中的任何值。同样,结果数据帧的顺序也不重要。
> library(sqldf)
> sqldf("Select * from df Group By c3, c4")
但为了加速和并行化我的程序,我必须消除对 sqldf 的调用。
> df[duplicated(df, by=c("c3", "c4")),]
[1] c1 c2 c3 c4
<0 rows> (or 0-length row.names)
选择重复的行而不选择只有 c3 和 c4 列重复的行。
> aggregate(df, by=list(df$c3, df$c4))
Error in match.fun(FUN) : argument "FUN" is missing, with no default
聚合需要一个函数应用于所有具有相同 c3 和 c4 值的行
> library(data.table)
> dt <- data.table(df)
> dt[,list(c1, c2) ,by=list(c3, c4)]
c3 c4 c1 c2
1: A 1 1 4
2: A 1 7 10
3: B 2 2 5
4: B 2 5 8
5: B 3 3 6
6: C 3 4 7
7: A 2 6 9
不会踢出具有非唯一值 c3 和 c4 的行,而
> dt[ ,length(c1), by=list(c3, c4)]
c3 c4 V1
1: A 1 2
2: B 2 2
3: B 3 1
4: C 3 1
5: A 2 1
确实会丢弃 c1 和 c2 的值,并将它们缩减为由传递的函数
length
指定的一维.
最佳答案
这是一个 data.table 解决方案。
library(data.table)
setkey(setDT(df),c3,c4) # convert df to a data.table and set the keys.
df[,.SD[1],by=list(c3,c4)]
# c3 c4 c1 c2
# 1: A 1 1 4
# 2: A 2 6 9
# 3: B 2 2 5
# 4: B 3 3 6
# 5: C 3 4 7
set.seed(1) # for reproducible example
df <- data.frame(c3=sample(LETTERS[1:10],2.5e5,replace=TRUE),
c4=sample(1:10,2.5e5,replace=TRUE),
matrix(sample(1:10,2.5e6,replace=TRUE),nc=10))
library(data.table)
DT.1 <- as.data.table(df)
DT.2 <- as.data.table(df)
setkey(DT.2,c3,c4)
f.nokeys <- function() DT.1[,.SD[1],by=list(c3,c4)]
f.keys <- function() DT.2[,.SD[1],by=list(c3,c4)]
library(microbenchmark)
microbenchmark(f.nokeys(),f.keys(),times=10)
# Unit: milliseconds
# expr min lq median uq max neval
# f.nokeys() 23.73651 24.193129 24.609179 25.747767 26.181288 10
# f.keys() 5.93546 6.207299 6.395041 6.733803 6.900224 10
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