r - 在 R 中查找字符串中连续重复项的索引

Question

这个问题在这里已经有了答案:





Find start and end positions/indices of runs/consecutive values

(2 个回答)



Get start and end index of runs of values [duplicate]

(3 个回答)


2年前关闭。




我有一个已转换为字符向量的字符串:

string <- c("A","A","A","C","G","G","C","C","T","T","T","T")

我希望能够输出一个表格，按照它们出现的顺序显示连续字母的索引。例如:

letter start end
A 1 3
C 4 4
G 5 6
C 7 8
T 9 12

我试过查看 str_locate和其他一些 str 函数，但一直无法弄清楚。任何帮助表示赞赏!

Answer 1

我将使用 cumsum之后 rle

s=rle(string)
v=cumsum(rle(string)$lengths)
data.frame('var'=s$values,'start'=v+1-s$lengths,'end'=v)
  var start end
1   A     1   3
2   C     4   4
3   G     5   6
4   C     7   8
5   T     9  12