regex - 通过匹配模式用另一个文本文件中的行替换字符串

Question

我有一个带有对应键 -> 值的文件:

sort keyFile.txt | head
ENSMUSG00000000001  ENSMUSG00000000001_Gnai3
ENSMUSG00000000003  ENSMUSG00000000003_Pbsn
ENSMUSG00000000003  ENSMUSG00000000003_Pbsn
ENSMUSG00000000028  ENSMUSG00000000028_Cdc45
ENSMUSG00000000028  ENSMUSG00000000028_Cdc45
ENSMUSG00000000028  ENSMUSG00000000028_Cdc45
ENSMUSG00000000031  ENSMUSG00000000031_H19
ENSMUSG00000000031  ENSMUSG00000000031_H19
ENSMUSG00000000031  ENSMUSG00000000031_H19
ENSMUSG00000000031  ENSMUSG00000000031_H19

我想用 temp.txt 中的“值”替换“键”的每个对应关系:

head temp.txt
ENSMUSG00000000001:001  515
ENSMUSG00000000001:002  108
ENSMUSG00000000001:003  64
ENSMUSG00000000001:004  45
ENSMUSG00000000001:005  58
ENSMUSG00000000001:006  63
ENSMUSG00000000001:007  46
ENSMUSG00000000001:008  11
ENSMUSG00000000001:009  13
ENSMUSG00000000003:001  0

结果应该是:

out.txt
ENSMUSG00000000001_Gnai3:001    515
ENSMUSG00000000001_Gnai3:002    108
ENSMUSG00000000001_Gnai3:003    64
ENSMUSG00000000001_Gnai3:004    45
ENSMUSG00000000001_Gnai3:005    58
ENSMUSG00000000001_Gnai3:006    63
ENSMUSG00000000001_Gnai3:007    46
ENSMUSG00000000001_Gnai3:008    11
ENSMUSG00000000001_Gnai3:009    13
ENSMUSG00000000001_Gnai3:001    0

我在 this AWK example 之后尝试了一些变体但正如你所看到的，结果不是我所期望的:

awk 'NR==FNR{a[$1]=$1;next}{$1=a[$1];}1' keyFile.txt temp.txt | head
 515
 108
 64
 45
 58
 63
 46
 11
 13
 0

我的猜测是 temp 的第 1 列与 keyValues 的第 1 列不匹配。有人可以帮我解决这个问题吗？
也欢迎 R/python/sed 解决方案。

Answer 1

像这样使用 awk 命令:

awk 'NR==FNR {a[$1]=$2;next} {
   split($1, b, ":");
   if (b[1] in a)
       print a[b[1]] ":" b[2], $2;
   else
       print $0;
 }' keyFile.txt temp.txt