r - knitr:在 Rmd 文档中编织单独的 Rnw 文档

Question

我有一个主 R Markdown 文档 (Rmd)，我想在其中 knit几个 单独的其中一个 block 中的 Rnw 文档(无子文档)。但是，当我调用 knit在 Rnw 文档上，包含的 R 代码块似乎没有被处理，导致尝试运行时出错 texi2pdf在他们。

情况说明:

内主。 rmd :

```{r my_chunk, echo=FALSE, message=FALSE, results='asis'}

... some code ...

knit("sub.**Rnw**", output = ..., quiet = TRUE)

tools::texi2pdf(tex_file)

... some code ...


```

是否需要一些额外的配置才能使这个场景工作？

Answer 1

有几个原因你不能直接做你想做的事(在 knit 环境中调用 knit)...

针织图案已经设置好了。
[在这种情况下， Markdown 模式，因此您需要将模式设置为“rnw”模式。 ]

解析 block (在设置正确的模式之后)会将 block 标签添加到现有的索引中，因此除非所有 block 都是唯一的，否则您将收到重复的 block 标签错误。
[这就是 knit_child 存在的原因。 ]

输出目标和其他选项已经设置好，因此您要么需要一个全新的 knitr 环境，要么保存、修改、恢复所有相关选项。

话虽如此，这似乎是完全预期的行为。

类似的东西

library(knitr)

files <- list.files( pattern = "*.Rnw", path = ".")
files

## [1] "test_extB.Rnw" "test_ext.Rnw"

for( f in files ) {
  system( paste0("R -e \"knitr::knit2pdf('", f, "')\"") )
}

list.files( pattern="*.pdf", path=".")

## [1] "test_extB.pdf" "test_ext.pdf"

或调用 Rscript在一个循环中应该可以解决问题(基于提供的信息)，这基本上是@kohske 在评论中表达的内容。