r - 在 R 中与轮廓和多边形相交

Question

我已经尝试了几天来创建轮廓，然后在同一个文件上绘制 shapefile 和轮廓。现在，我可以在同一个图上创建轮廓和 shapefile。我想用 shapefile 裁剪轮廓，只显示 shapefile。

数据 temp.csv 可以在此链接上找到 https://www.dropbox.com/s/mg2bo4rcr6n3dks/temp.csv
Shapefile 可以在以下位置找到:https://www.dropbox.com/sh/ztvmibsslr9ocmc/YOtiwB8p9p

脚本文件 image.scale.R 可以在以下位置找到“https://www.dropbox.com/s/2f5s7cc02fpozk7/image.scale.R”

到目前为止，我使用的代码如下:

## Required packages 
library(maptools) 
library(rgdal) 
library(sp) 
library(maptools) 
library(sm) 
require(akima) 
require(spplot) 
library(raster) 
library(rgeos)

## Set Working Directory 
setwd("C:\\Users\\jdbaba\\Documents\\R working folder\\shape")

## Read Data from a file 
age2100 <- read.table("temp.csv",header=TRUE,sep=",")

x <- age2100$x 
y <- age2100$y   
z <- age2100$z

####################################
##Load the shape file 
##################################### 
shapefile <- readShapePoly("Export_Output_4.shp")

fld <- interp(x,y,z)

par(mar=c(5,5,1,1)) filled.contour(fld)

###Import the image.scale 
source source("image.scale.R")

# http://menugget.blogspot.de/2011/08/adding-scale-to-image-plot.html

x11(width=8, height=7) 
layout(matrix(c(1,2), nrow=1, ncol=2), widths=c(6,1), height=6, respect=TRUE) 
layout.show(2)

par(mar=c(4,4,1,2)) 
image(fld,axes=T) 
contour(fld, add=TRUE)
#points(age2100$x,age2100$y, pch=".", cex=2,legend=F) 
plot(shapefile,add=T,lwd=2) 
box()
par(mar=c(4,0,1,4)) 
image.scale(fld, xlab="Eastings", ylab="Northings", xaxt="n", yaxt="n", horiz=FALSE)

axis(4)
mtext("Salinity", side=4, line=2.5)

上述代码的输出如下:



现在，我想从多边形 shapefile 中去除彩色渐变和轮廓，只留下相交部分。

任何帮助都受到高度赞赏。

研究:我找到了这个链接 https://gis.stackexchange.com/questions/25112/clip-depth-contour-with-spatial-polygon在堆栈交换 Gis 上，我尝试遵循此方法，但在创建轮廓时总是出错。

我在 https://stat.ethz.ch/pipermail/r-sig-geo/2009-May/005793.html 上发现了另一个类似的帖子.但我无法让它在我的数据集上工作。

我想在框中感谢 Marc 帮助我达到这一点。

谢谢。

Answer 1

事实上，@baptiste 为您提供了解决方案的强烈提示，recent paper by Paul Murrell .保罗慷慨地向我们提供了他整个论文手稿的代码，您可以从 his personal website 获得代码。 .在附带的主题上，保罗用这篇论文展示了可重复研究的漂亮例子。一般来说，我采取了以下方法:

从 shapefile 中提取纬度和经度坐标(执行此操作的函数是 here，Paul Hiemstra)，

用您的代码绘制所有内容，

并使用 polypath使用提取的坐标作为基线，删除 shapefile 定义的边界之外的所有内容。

#function to extract coordinates from shapefile (by Paul Hiemstra)
allcoordinates_lapply = function(x) { 
    polys = x@polygons 
    return(do.call("rbind", lapply(polys, function(pp) { 
           do.call("rbind", lapply(pp@Polygons, coordinates)) 
           }))) 
} 
q = allcoordinates_lapply(shapefile)

#extract subset of coordinates, otherwise strange line connections occur...
lat = q[110:600,1]
long = q[110:600,2]

#define ranges for polypath
xrange <- range(lat, na.rm=TRUE)
yrange <- range(long, na.rm=TRUE)
xbox <- xrange + c(-20000, 20000)
ybox <- yrange + c(-20000, 20000)

#plot your stuff
plot(shapefile, lwd=2)
image(fld, axes=F, add=T)
contour(fld, add=T)
#and here is the magic 
polypath(c(lat, NA, c(xbox, rev(xbox))),
         c(long, NA, rep(ybox, each=2)),
         col="white", rule="evenodd")