R - Ubuntu 上的 Shiny 服务器

Question

我对 R、Shiny、Shiny Server 和 Ubuntu 12.04 还很陌生。经过漫长的一天，除了实际让 Shiny 的服务器托管我的应用程序之外，我几乎一切正常。我正在尝试在本地托管我的应用程序。

这是我的错误:

Error in library(ggplot2) : there is no package called ‘ggplot2’ Calls: runApp ...
startAppDir -> sys.source -> eval -> eval -> library 
Execution halted

这是>sessionInfo() 生成的一些相关信息:

R version 3.0.3 (2014-03-06)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
 [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
 [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] grid      stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods  
[8] base     

other attached packages:
[1] gridExtra_0.9.1 shiny_0.9.1     ggplot2_0.9.3.1

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] bitops_1.0-6       caTools_1.16       colorspace_1.2-4   dichromat_2.0-0   
 [5] digest_0.6.4       gtable_0.1.2       httpuv_1.2.3       labeling_0.2      
 [9] MASS_7.3-30        munsell_0.4.2      plyr_1.8.1         proto_0.3-10      
[13] RColorBrewer_1.0-5 Rcpp_0.11.1        reshape2_1.2.2     RJSONIO_1.0-3     
[17] scales_0.2.3       stringr_0.6.2      tcltk_3.0.3        tools_3.0.3       
[21] xtable_1.7-3      
> 

我在没有 Shiny 服务器的情况下进行了测试，该应用程序运行良好

runApp("/var/shiny-server/www/examples/MY_APP/")

我还测试了 Shiny-server 附带的示例，它们工作正常，但不使用 ggplot2。

ggplot2 显然已安装，所以我怀疑这是一个权限问题(？)，但我不知道如何解决它...

谢谢你的帮助 !

* 解决方案*
使用 .libPaths() 我能够确定安装的自定义包

>install.packages("ggplot2")

放在主目录下

/home/USER/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/ggplot2

我不得不将文件夹“~3.0/”中的每个文件复制到

/usr/local/lib/R/site-library

它现在有效!感谢:D

Answer 1

尝试安装 ggplot2打包到系统目录(不是本地用户目录)，通过运行

sudo R
(within R session)
install.packages('ggplot2')

自 shiny可能以不同的用户名运行，它可能无法访问您本地安装的 R 库。