r - 控制哪些边在 r 中的 igraph 网络图中可见

Question

我在 igraph 中创建了以下图表

set.seed(1410)
df<-data.frame(
"site.x"=c(rep("a",4),rep("b",4),rep("c",4),rep("d",4)),
"site.y"=c(rep(c("e","f","g","h"),4)),
"bond.strength"=sample(1:100,16, replace=TRUE))

library(igraph)
df<-graph.data.frame(df)
V(df)$names <- c("a","b","c","d","e","f","g","h")
layOUT<-data.frame(x=c(rep(1,4),rep(2,4)),y=c(4:1,4:1))
E(df)[ bond.strength < 101 ]$color <- "red"
E(df)[ bond.strength < 67 ]$color <- "yellow"
E(df)[ bond.strength < 34 ]$color <- "green"
V(df)$color <- "white"
l<-as.matrix(layOUT)
plot(df,layout=l,vertex.size=10,vertex.label=V(df)$names,
edge.arrow.size=0.01,vertex.label.color = "black")

我想显示所有顶点/节点，但只显示 bond.strength > 34 的边缘(即只有红色和黄色边缘)。我可以通过将 bond.strength < 34 设置为白色来控制这一点，但是在我的实际数据集上完成时它并不漂亮，因为白色边缘“穿过”其他边缘，即



是否有其他方法可以在显示所有顶点的同时简单地控制哪些边可见？谢谢

Answer 1

我想知道如果将线条的颜色设置为透明会发生什么，例如:

E(df)[ bond.strength < 34 ]$color <- "#FF000000"

我用以下方法制作了该色号:

 hsv(1,1,1,alpha=0)

或者，您可以进入并从边缘列表中省略它们。