- html - 出于某种原因,IE8 对我的 Sass 文件中继承的 html5 CSS 不友好?
- JMeter 在响应断言中使用 span 标签的问题
- html - 在 :hover and :active? 上具有不同效果的 CSS 动画
- html - 相对于居中的 html 内容固定的 CSS 重复背景?
我从其他用户那里发现了“类似”的问题,但没有一个答案有效。我正在尝试安装这些软件包:
if (!require("BiocManager"))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("maEndToEnd", version = "devel")
if (!require("BiocManager"))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("ArrayExpress")
----------------------------------------------------------
Error: Bioconductor version '3.13' requires R version '4.1'
我的 R 版本 4.0.2,我的操作系统是 Ubuntu 20.10
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install(version = "3.12")
------------------------------------------------------
Error in packageVersion("BiocManager") :
there is no package called ‘BiocManager’
install("BiocManager")
------------------------------
Error: Can't find 'BiocManager'
´´´
I also tried so many things that I believe I just made worse the situation by eliminating packages from other libraries:
/usr/lib/R/site-library
/home/usr_name/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.0
这是我目前拥有的包目录:
library()
------------------------------------
Packages in library ‘/usr/lib/R/site-library’:
askpass
assertthat
backports
base64enc
BH
Metapackage
bit
bit64
bitops
blob
brew
callr
cli
cliapp
clipr
colorspace
and
etc...
Packages in library ‘/usr/lib/R/library’:
base
boot
for
class
cluster
Extended
etc ...
我该如何进行?如您所知,我是与信息学相关的所有方面的初学者。任何细节将不胜感激。
最佳答案
除非您确实需要特定版本的 BioConductor 软件包,否则您无需指定 version
.试试下面的 standard approach看看这是否有效:
install.packages("BiocManager")
library(BiocManager)
install() # Install BioConductor core packages
install("maEndToEnd")
install("ArrayExpress")
关于r - 错误 : Bioconductor version '3.13' requires R version '4.1' (R version 4. 0.2),我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/66437825/
我正在一个禁止互联网通信的电台工作。是否可以使用 R CMD INSTALL 安装 Bioconductor? Bioconductor 网站上没有记录这种类型的安装,我也没有找到有关此主题的任何信息
我知道如何使用 available.packages() 函数获取 CRAN(Names of R's available packages 和 List all packages available
我正在 Snakemake 中编写一个调用 R 脚本的管道。这个R脚本有自己的环境,里面有r-base、r-ggplot2和r-biocmanager。我还需要包裹 ggbio可以使用 biocman
我已经在我的 ubuntu 上安装了 R(3.4.0)。我想使用 EdgeR 包。我尝试按照 Bioconductor 网站上的安装说明安装 Bioconductor 软件包。 我在 R 中使用了以下
我在 Windows 7 上使用 R 版本 R-3.2.3 运行 RStudio (0.99.878)。 当我尝试使用以下命令从 bioconductor 安装软件包时,我收到一条错误消息: sour
关闭。这个问题需要更多focused .它目前不接受答案。 想改进这个问题吗? 更新问题,使其只关注一个问题 editing this post . 关闭 6 年前。 Improve this qu
我管理描述文件的依赖、建议和导入。最后我将我的包裹提交给 CRAN .但是在安装包的时候,它只安装存放在CRAN下的包。不适用于 bioconductor包。此外,它有一个 Mac OS 的包依赖错误
问题: 我正在开发一个 R 包,其中一个依赖包是 multtest。 它仅在 Bioconductor 上可用,名称为 here .我正在使用 开发工具 来构建包。而且,当我运行时 开发工具::安装(
我无法在 R 3.1.1 中访问许多 Bioconductor 包,对此我感到非常失望。如何从 R 3.1.1 降级到 R 3.0.2 或其他版本? 请注意 this solution对我来说还不够好
我需要使用 BiomaRt,最好是 3.1 版本中的版本。请参阅:http://www.ensembl.info/blog/2015/06/01/biomart-or-how-to-access-th
这个问题在这里已经有了答案: How to install 2 different R versions on Debian? (4 个答案) 关闭 9 年前。 大家好,我目前在装有 Biocond
我很难理解自动完成如何适用于 BioConductor 中名为“SummarizedExperiment”的定制 S4 类。 这是取自 example(SummarizedExperiment) 的简
我正在尝试在 Python Jupyter 笔记本中使用 rpy2 从 Bioconductor 安装“pcaMethods”。 这是我尝试过的 from rpy2.robjects.packages
我想从 string-db.org 中提取一个大型网络,因为 Web 界面不支持超过 2000 个蛋白质。我需要大约 100.000 到 200.000 种蛋白质。所以我正在使用 R biocondu
我一直在尝试在 R(版本 4.0.5)中安装 Bioconductor。每次我尝试插入以下代码时,都会遇到一些错误,例如: >if (!requireNamespace("BiocManager",
您好(这是我的第一条消息,所以如果有什么不对的地方,我很抱歉), 我已经有这个问题几天了。我无法安装新的软件包,我读过类似的 question但就我而言,只有当我尝试安装新的 时才会出现问题。生物导体
每个人! 我正在尝试安装 Bioconductor 包“cummeRbund”并且经常失败。我试过了biocLite("cummeRbund")启用 BiocInstaller 的命令,install
我正在尝试部署 shinyapp 但出现以下错误: > deployApp() Preparing to deploy application... Update application curren
我对ComBat() function有疑问来自SVA R 中的 Bioconductor 包。 在我的笔记本电脑上(运行 Linux Ubuntu 18 的 Latitude 5590)系统),运行
我正在使用 Bioconductor 包 CMA对微阵列数据集中的 SVM 分类器执行内部蒙特卡洛交叉验证 (MCCV)。 CMA 内部使用 e1071 R 包进行 SVM 工作。 该数据集包含 45
我是一名优秀的程序员,十分优秀!