bash - 有人通过命令行使用过 COPASI 吗？

Question

我正在尝试在命令行中运行 COPASI，但文档很少。

我已经下载并解压缩了二进制文件，但我不确定如何继续执行导入 SBML 文件这样简单的操作？

这是我找到的所有文档:
http://copasi.org/Support/User_Manual/Model_Creation/Commandline_Version_and_Commandline_Options/

它没有说明我使用哪个命令来调用 COPASI？

Answer 1

COPASI 的命令行版本是 CopasiSE ，您可以在 GUI 之外安装它 CopasiUI通过此处的任何来源http://copasi.org/Download/ .
例如，见 https://github.com/ICB-DCM/solverstudy/blob/master/Bash_Scripts/install_copasi.sh ，在这种情况下，可执行文件位于本地文件夹中。
关于使用，我不确定是否有大量的 API 文档可用。它可能不会有太大帮助，但这是我们如何通过 Python 将其包装在一项研究中以调用底层 CPS 模型文件 https://github.com/ICB-DCM/solverstudy/blob/master/Python_Scripts/simulation_wrapper_copasi.py#L77 .