r - 为什么R的热图不能始终如一地作用于颜色单元？

Question

R中的heatmap函数应该可以帮助人们解释矩阵元素的相对值。但是，似乎无法在给定图中对单元格进行统一着色，这是正确解释相对值的严重障碍。

例如，让我们通过串联普通随机变量的列来生成一些数据:

foo <- cbind(replicate(10,rnorm(10)))

现在，如果我们将foo的列相关联，则可以验证对角线条目中得到1，因为任何列与其自身的相关性为1:

cor.matrix <- cor(foo)

但是当我们绘图时:

heatmap(cor.matrix,Rowv=NA,Colv=NA)

(我们在这里抑制树状图，尽管这似乎无关紧要)

如您所见，对角线单元的颜色不一致

谁能解释这里发生了什么？

Answer 1

默认情况下，热图按“行”缩放。

heatmap(cor.matrix,Rowv=NA,Colv=NA, scale="none")