python - Pubmed eutils esearch 的排序选项？

Question

我正在使用 BioPython 通过 eutils API 查询 Pubmed 数据库。 esearch端点有一个排序选项，但 API 文档没有列出这个值的所有选项。

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK25499/#_chapter4_ESearch_

示例调用:

Entrez.esearch(db="pubmed", term=search_term, rettype=rettype, retmax=retmax,
               sort=sort_method)

我知道的值(value)观适用于 sort_method :

'发布日期'

'相关性'

'第一作者'

'最后一位作者'

'标题'

'期刊'

但是，我不确定如何指定默认排序顺序，即“最近”；实际上，这似乎是按 Pubmed ID 值排序的。 'recent', 'most recent', 'pmid', 'id', 和 'default' 都给出了 OutputMessage "Unknown sort schema...."。

其他人知道如何明确指定默认顺序吗？

Answer 1

不是 100% 确定我是否正确回答了您的问题。如果您未指定排序顺序，则将使用默认排序顺序。

handle = Entrez.esearch(db="pubmed", term='TRPV1')
records = Entrez.read(handle)
print('\n'.join(records['IdList']))

将按照与 PubMed 网页上相同的顺序为您提供 ID。