Sed 保留数字并丢弃扩展名

Question

我有一个文件，其标题包含以下模式(制表符分隔)

1.mapped.bam 2.mapped.bam 3.mapped.bam ....

我愿意

SAMPLE_1 SAMPLE_2 SAMPLE_3 .....

我试过:

sed -r 's/([0-9])(.mapped.bam)/SAMPLE_\1/g 

但是得到了

1SAMPLE_1 2SAMPLE_2 3SAMPLE_3 ???

Answer 1

您可以使用以下 POSIX ERE 解决方案:

sed -E 's/([0-9]+)\.mapped\.bam/SAMPLE_\1/g'

等效的 BRE POSIX 解决方案是

sed 's/\([0-9][0-9]*\)\.mapped\.bam/SAMPLE_\1/g'

参见 online sed demo

这里，

• ([0-9]+) - 第 1 组(后来用 RHS 中的 \1 占位符表示，替换模式):一位或多位数字<
• \.mapped\.bam - 文字 .mapped.bam 子字符串。

请注意，在 POSIX BRE 和 ERE 中，括号表达式外的点必须转义以匹配文字点，并且捕获括号必须在 POSIX BRE 风格中转义。