python - 如何使用一组指定的 EEG channel 在 Python MNE 中绘制蒙太奇？

Question

我已经使用 Python 的 MNE 包加载了一些 EEG 数据。数据有 46 个从 10-20 蒙太奇获得的记录 channel ，但我们已经确定了许多死 channel ，只想关注剩余的 channel 。

我可以删除 channel ，但我不知道如何绘制更新的蒙太奇。

首先我加载我的 edf 文件，制作一个副本并删除所需的 channel :

import mne as mn
raw = mn.io.read_raw_edf("patient_001.edf",preload=True)
raw_temp=raw.copy()
raw_temp.drop_channels(['E', 'LIO', 'RIO', 'X1', 'X2', 
'X3','X4''X5', 'X6', 'X7', 'X8', 'X9', 'X10', 'X11', 'O2%', 'HR', 
'DC03','DC04', 'EEG Mark1', 'EEG Mark2', 'BP1', 'BP2','STI 014'])

我检查过， channel 被删除了。我现在想要做的是仅使用我剩余的 23 个 channel 绘制更新的蒙太奇:

raw_temp.info["ch_names"]

['Fp1',
'Fp2',
'F3',
'F4',
'C3',
'C4',
'P3',
'P4',
'O1',
'O2',
'F7',
'F8',
'T7',
'T8',
'P7',
'P8',
'Fz',
'Cz',
'Pz',
'A1',
'A2'，
'T1',
'T2']

根据我对 channel 布局的极其有限的了解，我理解字母代表位置，数字代表半球，例如F4 表示额叶，右侧。

以下打印 10-20 93 channel 布局的蒙太奇:

montage = mn.channels.read_montage("standard_1020")
raw_temp.set_montage(montage)
montage.plot()

其他蒙太奇选项列于

https://github.com/mne-tools/mne-python/blob/master/mne/channels/montage.py

但我没有看到 46 channel 选项。

有没有办法以某种方式为我的 23 个 channel 绘制蒙太奇？

Answer 1

如果只想绘制电极布局，可以使用 Layout类而不是 Montage类(class):

import mne

layout = mne.channels.read_layout("EEG1005")
selection = [
    "Fp1",
    "Fp2",
    "F3",
    "F4",
    "C3",
    "C4",
    "P3",
    "P4",
    "O1",
    "O2",
    "F7",
    "F8",
    "T7",
    "T8",
    "P7",
    "P8",
    "Fz",
    "Cz",
    "Pz",
    "A1",
    "A2",
    "T1",
    "T2",
]
picks = []
for channel in selection:
    picks.append(layout.names.index(channel))
display = layout.plot(picks=picks)

这给你 至少对于 mne==0.18.0 .