r - 使用 R 绘制分类数据

Question

我有一个蛋白质名称列表(P1，P2，...，Pn)，它们被分类为三种不同的表达水平高(H)，中(M)和低(L)，如在三个实验条件下测量的(Exp1 、Exp2 和 Exp3)。


我想绘制一个如图底部所示的图，左侧是蛋白质名称，顶部是实验名称，高、中、低类别分别用红色、蓝色和绿色表示。

我是 R 的新手，非常感谢您的帮助。

提前致谢

Answer 1

您可以创建一个数据格式如下(制表符分隔)的文件:

pv   exp  val
1    1    H
2    1    L
3    1    L
4    1    M
1    2    H
2    2    H
3    2    M
4    2    H
1    3    L
2    3    L
3    3    L
4    3    M

并使用以下命令来抓取和绘制它们:
mat <- read.table(file.choose(),header=T) # 将文件读入内存
attach(mat) # 将标题名称映射到变量名称
plot(pv~exp,col=val) # 将类别相互绘制并使用 val (H,M,L)作为颜色数组。 R 会自行将这些值分配给颜色。您还可以使用 val 数组创建一个颜色数组以将 (H,M,L) 转换为 (Blue,Red,Green)...但还有其他文档可用于此目的。