r - 无法在 R 中安装基于 Fortran 的包 - "gfortran -m32:not found"

Question

我正在编写一个包含 Fortran 源代码的 R 程序包。简而言之，我的问题是当我尝试安装包时出现错误“gfortran -m32:未找到”，但是，当我没有安装包时，我可以使用 gfortran -m32 编译我的代码。

详细版本:

我已经安装了最新版本的 R(3.1.1) 以及最新版本的 Rtools(31) 并相应地重命名了我的路径变量 (C:\Rtools\bin;C:\Rtools\gcc-4.6.3\bin;C:\Program Files\R\R-3.1.1\bin\x64;C:\msys;C:\Program Files (x86)\SSH Secure Shell;C:\Program Files\MiKTeX 2.9\miktex\箱)。

出于测试目的，我从 CRAN 下载了具有 Fortran 源代码的 PropClust 包。

构建后键入“R CMD INSTALL PropClust_1.4.tar.gz”时，出现以下错误:

* installing *source* package 'PropClust' ...
** libs

*** arch - i386
C:/PROGRA~1/R/R-31~1.1/etc/i386/Makeconf:202: warning: overriding recipe for target `.m.o'
C:/PROGRA~1/R/R-31~1.1/etc/i386/Makeconf:195: warning: ignoring old recipe for target `.m.o'
gfortran -m32   -O3  -mtune=core2 -c  PropClustParallelTrials.f90 -o PropClustParallelTrials.o
gcc -m32 -I"C:/PROGRA~1/R/R-31~1.1/include" -DNDEBUG     -I"d:/RCompile/CRANpkg/extralibs64/local/include"     -O3 -Wall  -std=gnu99 -mtune=core2 -c minWhichMin.c -o minWhichMin.o
gfortran -m32 -shared -s -static-libgcc -o PropClust.dll tmp.def PropClustParallelTrials.o minWhichMin.o -Ld:/RCompile/CRANpkg/extralibs64/local/lib/i386 -Ld:/RCompile/CRANpkg/extralibs64/local/lib  -LC:/PROGRA~1/R/R-31~1.1/bin/i386 -lR
gfortran -m32: not found
C:/PROGRA~1/R/R-31~1.1/etc/i386/Makeconf:202: warning: overriding recipe for target `.m.o'
C:/PROGRA~1/R/R-31~1.1/etc/i386/Makeconf:195: warning: ignoring old recipe for target `.m.o'
cygwin warning:
  MS-DOS style path detected: C:/PROGRA~1/R/R-31~1.1/bin/i386/Rterm.exe
  Preferred POSIX equivalent is: /cygdrive/c/PROGRA~1/R/R-31~1.1/bin/i386/Rterm.exe
  CYGWIN environment variable option "nodosfilewarning" turns off this warning.
  Consult the user's guide for more details about POSIX paths:
    http://cygwin.com/cygwin-ug-net/using.html#using-pathnames
no DLL was created
ERROR: compilation failed for package 'PropClust'
* removing 'C:/Users/kamicz/Documents/IsotopeR/PropClust.Rcheck/PropClust'

虽然它说“gfortran -m32: not found”，但我已经在同一个窗口中使用相同的选项(gfortran -m32 -O3 -mtne=core2 -c a.f90 -o a.out)编译了我的代码，没有问题。以前有人遇到过这个问题吗？如果重要的话，我正在运行 Windows 7 64 位。

Answer 1

我有一个类似的问题:R 正在调用 gfortran-4.8 - 我系统上无法识别的命令 - 而不是 gfortran。此问题在我的主目录中创建文件 ~/.R/Makevars 后得到修复。以下是指向适当的 gfortran 安装的 Makevars 的内容:

F77 = gfortran
FC = gfortran
FLIBS = -L/usr/local/gfortran/lib