r - 如何确定 [R] 中的命名空间导入顺序

Question

我需要清理一个 R 实例以将其恢复到启动时的原始状态。到目前为止，我正在做的是:

启动时，记录加载的包和命名空间

original_packages <- grep('^package:', search(), value = TRUE)
original_namespaces <- loadedNamespaces()

当我需要刷新实例时，分离启动时不存在的每个加载的包:

for (pkg in grep('^package:', search(), value = TRUE)) {
    if (! pkg %in% original_packages){
        detach(pkg, unload=TRUE, force=TRUE, character.only=TRUE)
    }
}

问题是，如果我加载了一个包含一堆导入命名空间的包，例如 ggplot2，这些命名空间会保持加载状态，我必须按照导入的顺序从高级向下卸载它们。只是盲目地卸载它们是行不通的，因为我收到“命名空间‘x’是由‘y’、‘z’导入的，因此无法卸载”错误。

这是可重现的示例:

original_packages <- grep('^package:', search(), value = TRUE)
original_namespaces <- loadedNamespaces()

library(ggplot2)
library(plyr)

loadedNamespaces()

for (pkg in grep('^package:', search(), value = TRUE)) {
    if (! pkg %in% original_packages){
        detach(pkg, unload=TRUE, force=TRUE, character.only=TRUE)
    }
}

for (ns in loadedNamespaces()) {
    if (! ns %in% original_namespaces){
        unloadNamespace(ns)
    }
}

有没有办法找出命名空间导入层次结构？如果是这样，那么我应该能够正确地订购最后一个循环......

Answer 1

好的，我已经为公认的hacky需求拼凑了一个hacky解决方案。任何关于如何更好地做到这一点的建议将不胜感激。特别是，我对 <<- 不太满意全局赋值namespace_depths目的。

original_packages <- grep('^package:', search(), value = TRUE)
original_namespaces <- loadedNamespaces()

library(ggplot2)
library(plyr)

loadedNamespaces()

new_packages <- Filter(function(pkg) { ! pkg %in% original_packages }, grep('^package:', search(), value = TRUE))

new_namespaces <- Filter(function(ns) { ! ns %in% original_namespaces }, loadedNamespaces())

get_imports <- function(ns, depth) {

    imports <- Filter(function(ns) { ! ns %in% original_namespaces }, names(getNamespaceInfo(ns, 'imports')))
    if (length(imports) == 0 ) {
        if ( is.null(namespace_depths[[ns]]) || namespace_depths[[ns]] < depth){
            namespace_depths[[ns]] <<- depth
        }
        return()
    }
    for (imported_ns in imports){
        get_imports(imported_ns, depth + 1)
    }
    if ( is.null(namespace_depths[[ns]]) || namespace_depths[[ns]] < depth){
        namespace_depths[[ns]] <<- depth
    }
}

namespace_depths <- list()
sapply(new_namespaces, get_imports, 0)

for (ns in names(namespace_depths)[order(unlist(namespace_depths))]) {
    if (! ns %in% original_namespaces){
        unloadNamespace(ns)
    }
}

for (pkg in new_packages){
    detach(pkg, unload=TRUE, force=TRUE, character.only=TRUE)
}