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我有新西兰鸟类观测的经度和纬度,存储在 Count.df
中。 , 在变量 count
下, longitude
, 和 latitude
.然而,其中一些出现在近海/海洋中(这是一个公民科学数据集)。
我想根据这些点是否超出 maps::map("nz")
中提供的信息来对这些点进行子集化。 ,有两个原因:
Count.df
中创建新变量基于它们是否属于
map("nz")
所描述的组 (1:3) 之内/之外,保存为“nzmap.dat”?
Count.df
的子集, 我有超过 17000 次观察,这里有 10 次。请注意“计数”的值对这个问题没有意义。
df <- readr::read_table2(
"count longitude latitude
3 174.7889 -41.24632
1 174.7764 -41.25923
4 176.8865 -39.67894
1 174.7656 -36.38182
2 175.5458 -37.13479
2 175.5458 -37.13479
1 176.8862 -39.67853
1 170.6101 -45.84626
5 174.9162 -41.25709
2 176.8506 -39.51831"
)
最佳答案
不幸的是,它很难使用 maps
数据到空间过滤点,因为数据实际上是用于绘图而不是用于进行空间操作。幸运的是,使用 sf
相当容易。包来做这种空间工作。
rnaturalearth
获得新西兰边界。包,这是一个方便的国界来源。我做了一些转换以仅保留 shapefile 中最大的三个多边形,否则我们将绘制许多可能与此 map 无关的遥远岛屿。 tibble
只是一列经度和一列纬度。我们使用 st_as_sf
将其转换为点几何。并绘制它,以显示它的样子。 st_within
检查每个点是否在 nz
内边界。 st_within
为每个点返回该点所在的多边形索引列表,因此我们可以使用 lengths
得到我们想要的结果。这里是 0
不在边界内和任何 1
是在边界内。使用这个新绘图 on_land
属性显示离岸点已适当着色。 library(tidyverse)
library(sf)
#> Linking to GEOS 3.6.1, GDAL 2.2.3, proj.4 4.9.3
library(rnaturalearth)
nz <- ne_countries(country = "New Zealand", returnclass = "sf", scale = "large") %>%
st_cast("POLYGON") %>%
mutate(area = st_area(geometry)) %>%
top_n(3, area)
#> Warning in st_cast.sf(., "POLYGON"): repeating attributes for all sub-
#> geometries for which they may not be constant
points <- tibble(
x = runif(1000, st_bbox(nz)[1], st_bbox(nz)[3]),
y = runif(1000, st_bbox(nz)[2], st_bbox(nz)[4])
)
points
#> # A tibble: 1,000 x 2
#> x y
#> <dbl> <dbl>
#> 1 167. -44.5
#> 2 175. -40.9
#> 3 177. -43.8
#> 4 167. -44.8
#> 5 173. -39.3
#> 6 173. -42.1
#> 7 176. -41.9
#> 8 171. -44.9
#> 9 173. -41.2
#> 10 174. -39.5
#> # ... with 990 more rows
points <- st_as_sf(points, coords = c("x", "y"), crs = 4326)
plot(nz$geometry, col = "red")
plot(points, pch = 19, cex = 1, add = TRUE)
points <- points %>% mutate(on_land = lengths(st_within(points, nz)))
#> although coordinates are longitude/latitude, st_within assumes that they are planar
plot(nz$geometry, col = "red")
plot(points, pch = 19, cex = 1, add = TRUE)
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