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awk - Awk:如何每四行替换一个字符串？

转载作者：行者123 更新时间：2023-12-04 15:56:28

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我有一个文件，其中每四行是这样的：

  HISEQ15:454:D27KKACXX:6:2316:16241:100283 1:N:0:GTTTCG

（对于那些感兴趣的人，此文件包含DNA序列）

我需要删除空格后的所有内容，除了空格后的第一个数字（在本例中为 1），然后在字符串的开头和数字之间插入 /，因此得到以下信息：

  HISEQ15:454:D27KKACXX:6:2316:16241:100283/1

我只知道Perl，而我的文件> 10GB可能会永久占用它，因此希望您能对awk有所帮助。

最佳答案

那这个呢？

awk 'BEGIN{OFS="/"} NR%4==1{$2=$2*1}1' file

使用 NR%4==1，我们得到所有的行号均为4K + 1。在这些行中，我们执行 {$2=$2*1}，即将空格后的第二部分转换为仅数字。然后使用 {}1打印所有行。
为了使记录由“ /”分隔，我们使用 BEGIN{OFS="/"}部分，因为OFS代表“输出字段分隔符”。

注意，条件 NR%4==1可以根据要改变的字符串的位置而改变。如果是第1，第5，第9 ...就可以了。如果是第二，第六...则 NR%4==2，依此类推。

测试

$ cat a
HISEQ15:454:D27KKACXX:6:2316:16241:100283 1:N:0:GTTTCG 
a
b
d
HISEQ15:454:D27KKACXX:6:2316:16241:100283 7:N:0:GTTTCG 
ad
f
d
HISEQ15:454:D27KKACXX:6:2316:16241:100283 9:N:0:GTTTCG 
$ awk 'BEGIN{OFS="/"}NR%4==1{$2=$2*1}5' a
HISEQ15:454:D27KKACXX:6:2316:16241:100283/1
a
b
d
HISEQ15:454:D27KKACXX:6:2316:16241:100283/7
ad
f
d
HISEQ15:454:D27KKACXX:6:2316:16241:100283/9

关于awk - Awk:如何每四行替换一个字符串？，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/18234703/

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