r - 在 docker 文件中安装私有(private) R 包

Question

我第一次尝试使用 Docker 和 ShinyProxy，在这个过程的一开始我就很挣扎。

我开发了一些在本地运行良好的 Shiny 应用程序，我正在考虑在我网站的一些文章中部署它们。

那些 Shiny 的应用程序使用我自己编写的 2 个包，它们位于我的计算机本地。

如何在我的 Dockerfile 中安装这些私有(private) R 包，以便“容器”可以访问它们？？？

我看过大量从 CRAN 安装软件包的示例，我对此没有任何问题。但是，我找不到从本地存储库安装自己的软件包的方法。

目前，我有一个名为“DockerEC”的文件夹，其中包含以下文件:

'App.R'
'run_app.R'
'installpackages.R'
'Dockerfile'

在我本地 Shiny 的应用程序中，我只需使用以下命令安装这些软件包:

install.packages("/Users/name/Documents/R/Package_NAME", repos = NULL, type="source")

我在 installpackages.R 文件中写了这行代码，但我无法运行这个文件，因为我收到一个错误:“没有这样的文件或目录”。

我用了

COPY /Users/name/Documents/R/DockerEC/installpackages.R /Users/name/Documents/R/DockerEC/installpackages.R 

进而

RUN Rscript /Users/name/Documents/R/DockerEC/installpackages.R  

在我的 docker 文件中，但不明白为什么我找不到文件？

任何人都有在 dockerfile 中安装私有(private) R 包的具体示例？我缺少一个具体的例子来理解如何做到这一点......

Answer 1

试试 Dockerfile下面，它对我有用:

FROM rocker/r-ver:3.6.1

RUN mkdir ./private_pkgs

COPY /Users/name/Documents/R/your_package.tar.gz ./private_pkgs/your_package.tar.gz

RUN R -e "install.packages('private_pkgs/your_package.tar.gz', repos = NULL, type = 'source')"