matlab - csv 格式 matlab/gephi

Question

几天来，我一直在一个棘手的数据集上同时使用 k-means 和 Fuzzy c 均值，它产生的结果还不错，但我想可视化和操作图形输出，我找到了一个很棒的可视化工具 Gephi .如果您单击主页上的图片，它将加载您可以观看的视频。

在 gephis 支持的图形格式页面上 here他们有一个可能的导入格式列表:

* GEXF
* GDF
* GML
* GraphML
* Pajek NET
* GraphViz DOT
* CSV
* UCINET DL
* Tulip TPL
* Netdraw VNA
* Spreadsheet

查看 matlab，我可以输出集群数据的格式可能是 csv。在 gehpis 网站上 here他们解释了格式、边缘列表、混合、矩阵。

我不太确定他们的意思。在 matlab 中使用 FCM 我得到 3 个输出 centers、U 和 objFun。

[centers, U, objFun] = fcm(data, clusters, options);

所以我的问题是如何根据 they 格式的数据构建 CSV 文件要求。

https://gephi.org/users/supported-graph-formats/spreadsheet/

http://forum.gephi.org/viewtopic.php?t=1896

我将以 100 分的赏金奖励任何能提供帮助的人，因为这个可视化工具是我从现在开始想使用的工具，到目前为止，堆栈上还没有任何问题可以解释如何做到这一点。因此，它可能对 gephi/matlab 用户的 future 和社区有用。

Answer 1

这里的问题是您需要能够将数据表示为图表。即使您的数据不是图表，它仍然可以表示为可视化。您需要确定数据中的哪些可以表示节点，哪些可以表示边。一旦你这样做了，将数据写出到一个可以被 Gephi(或其他图形/网络可视化工具)导入的文件就相当简单了。由于您尚未发布数据示例，因此很难建议如何做到这一点。

问自己以下关于您的数据的问题:

1. 什么可以表示为一个节点？
2. 什么可以表示为连接#1 中定义的节点的边？

每个节点都必须有一个与之关联的唯一标识符(这可以是一个简单的数值或字符串)。

这是困难的部分，因为将集群数据表示为图形，如果做得不正确，可能会从可视化中提供误导性的解释。

完成此操作后，将其转换为文件格式的最简单方法是边列表。