r - 无法理解 seqefsub 函数的输出

Question

一个简单的例子:

t<-data.frame(id=rep(1:3, each=3), time=c(0,2,4,0,4,2,0,2,2), event=rep(c("A", "B", "C"), 3))
tmp<-seqecreate(t)
seqefsub(tmp, min.support=2)

我得到:

      Subsequence Support Count
      1         (A)       1     3
      2     (A)-(B)       1     3
      3     (A)-(C)       1     3
      4         (B)       1     3
      5         (C)       1     3

我不明白为什么 (A)-(B) 和 (A)-(C) 计数为 3。我有三个序列:

    (A)-2-(B)-2-(C) 
    (A)-2-(C)-2-(B) 
    (A)-2-(B,C)

应该是:

      Subsequence Support Count
      1         (A)       1     3
      2         (B)       1     3
      3         (C)       1     3
      4     (A)-(B)       0.66  2
      5     (A)-(C)       0.66  2

非常感谢任何想法。

Answer 1

您看到 (A) - (B) 计数的原因因为 3 是因为 seqefsub读取序列为 (A) - <anything can go here> - (B)作为 (A) - (B) 的实例，并且您有三个这样的实例。

如果您想查看 (A) - (B) 所在的子序列连续且仅连续出现，尝试:

>seqefsub(tmp, min.support=2, constraint = seqeconstraint(window.size = 2))
  Subsequence   Support Count
1         (A) 1.0000000     3
2         (B) 1.0000000     3
3         (C) 1.0000000     3
4     (A)-(B) 0.6666667     2
5     (A)-(C) 0.6666667     2

Computed on 3 event sequences
   Constraint Value
  window.size     2
 count.method  COBJ