R找不到函数 "%dopar%"

Question

在Windows 10的RStudio中，我编写了一个并行执行计算的函数，如下所示:

doSomething = function(a, b, c) {

    # Inner function that does the actual work when parallelised
    work = function (a, b, c) {
        # Do something
        e = func1(a, b)
        f = func2(c)
        result = e + f

        return(result)
    }

    # Carry out work in parallel
    cl = makeCluster(6)
    registerDoParallel(cl)
    output = foreach(i = 1:10, .packages=c("foo", "bar")) %dopar%
        work(a, b, c)
    stopCluster(cl)

    return(output)
}

如果我从R脚本将函数加载到内存中，则可以正常工作。但是，我想将其包含在我正在编写的程序包中。这样，在包文件中，我小心地标识了外部函数的 namespace ，并在 DESCRIPTION文件中引用了它们的包。例如:

doSomething = function(a, b, c) {

    # Inner function that does the actual work when parallelised
    work = function (a, b, c) {
        # Do something
        e = foo::func1(a, b)
        f = bar::func2(c)
        result = e + f

        return(result)
    }

    # Carry out work in parallel
    cl = parallel::makeCluster(6)
    doParallel::registerDoParallel(cl)
    output = foreach::foreach(i = 1:10, .packages=c("foo", "bar")) %dopar%
        work(a, b, c)
    parallel::stopCluster(cl)

    return(output)
}

并在 DESCRIPTION文件中:

...
Imports:
    foo,
    bar,
    doParallel,
    foreach,
    parallel

(编辑) NAMESPACE文件包含以下内容:

# Generated by roxygen2 (4.1.1): do not edit by hand

export(doSomething)

问题是，当我构建程序包并从该程序包中运行该函数时，出现以下错误，执行停止:

Error in doSomething(a, b, c):
    could not find function "%dopar%"

由于 %dopar%是运算符，而不是函数，因此我不能在我的包函数中以 foreach::开头。

我不确定要使其正常工作需要做什么。此外，我所阅读的类似问题中有95％是由 .packages()的遗漏引起的，而不是导致 %dopar%运算符本身未被识别而导致的错误。这似乎不是这里的原因。

请帮忙!

Answer 1

foreach％dopar％问题的快速解决方案是重新安装以下软件包:

install.packages("doSNOW")

install.packages("doParallel") 

install.packages("doMPI")

以上软件包负责R中的并行性。这些软件包的旧版本中存在的错误已被删除。我应该提到，即使您没有在项目/程序包中直接使用这些程序包，它也很有可能会有所帮助。