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这可能不重要,但我一直很好奇。
在 JAGS/BUGS 中构建模型时,我最初被教导使用 pow()
处理幂转换函数(例如 tau <- pow(sigma, -2)
将正态分布中的标准差参数转换为精度参数)但很多时候,我最终会改用简单的算术运算符。
我的问题是:pow()
是否有编程或句法上的好处? ,还是仅仅是美学问题?
通过初步探索,这里有一个很好的、长期的玩具简单线性回归,指定了两种方式。我正在使用 JAGS,在 R 中使用 R2jags 包调用。
# first some fake data
N <- 1000
x <- 1:N
y <- x + rnorm(N)
# model 1
cat('model {
for (i in 1:N) {
y[i] ~ dnorm(y.hat[i], tau)
y.hat[i] <- a + b * x[i]
}
a ~ dnorm(0, .0001)
b ~ dnorm(0, .0001)
tau <- pow(sigma, -2) ### this is the only difference
sigma ~ dunif(0, 100)
}', file="test1.jags")
# model 2
cat('model {
for (i in 1:N) {
y[i] ~ dnorm(y.hat[i], tau)
y.hat[i] <- a + b * x[i]
}
a ~ dnorm(0, .0001)
b ~ dnorm(0, .0001)
tau <- 1/(sigma*sigma) ### this is the only difference
sigma ~ dunif(0, 100)
}', file="test2.jags")
两者产生的后验概率基本相同(未显示,您只需要相信我 ;)),并且运行时间基本相同。
test.data <- list(x=x,y=y,N=N)
# give both a nice long run
system.time(test1.jags.out <- jags(model.file="test1.jags", data=test.data,
parameters.to.save=c("a","b","tau","sigma"), n.chains=3, n.iter=100000))
user system elapsed
166.85 0.03 166.97
system.time(test2.jags.out <- jags(model.file="test2.jags", data=test.data,
parameters.to.save=c("a","b","tau","sigma"), n.chains=3, n.iter=100000))
user system elapsed
162.42 0.00 162.75
有什么我没发现的区别吗?
最佳答案
从至少 Jags 版本 4.0.0 开始,它们在这一点上是相同的。 See here
在 jags 论坛的特定帖子中重要的文本是:
“Pow 函数的别名是“pow”,因此它可以被调用为“a^b” 或作为“pow(a,b)”
继续使用您觉得更舒服的那个。我相信原始 pow
函数的使用来自 winbugs。
关于r - JAGS/BUGS 中的 pow() 运算符,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/42515795/
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