r -\Sexpr{} 在 .tex 文件中引用 R 对象

Question

我正在使用 RStudio 0.98.501 和 MacTex 2013 运行分析并编译手稿。在我的设置中，我使用 master.rnw定义 LaTeX 模板的文件。该文件输入了一些合作者贡献的手稿 .tex 文件(它们实际上是 work in Word and I convert to .tex ，但这在这里并不重要)。

保持 master.rnw 中的元素清洁，我将分析编码为 child .rnw file并将我的分析手稿文本写在同一个子文件中。在这个 child 的 R 代码块中定义一个对象很容易 .rnw文件，例如 result <- 1+2并在子 .rnw 中引用此对象文本，例如 \Sexpr{result} .

我遇到了一种情况，我想在运行分析子程序之前引用一个分析对象.rnw文件—在单独的方法部分报告基本 N=100 .tex – 所以我尝试了两种从 master.rnw 运行基本分析的方法输入 methods.tex 之前的文件引用对象的文件:(a) 运行一个子文件，该子文件来源为 .R文件和 (b) 采购 .R来自 master.rnw 中的代码块的文件文件。我认为结果不应该有差异。就我而言，没有:它们都失败了。

在 .tex 中引用时，LaTeX 无法识别 R 对象。我包括的文件。当然，当我从 master.rnw 中引用 R 对象时，它会很好。文件。有没有办法使用\Sexpr在 .tex文件并让 LaTeX 抓取 R 对象？

我创建了一个最小示例并将文件上传到 GitHub如果有人想尝试一下。

% Knitr child example

<<knitr, include=FALSE>>=
  library(knitr)
  opts_knit$set(self.contained=FALSE)
@

\documentclass{article}
\begin{document}

% run analysis and reference objects, codeA and codeB, via \Sexpr{} in methods.tex that is included later

% attempt 1: run source file defining codeA object via a child rnw file
<<pre-results1, child='child1.rnw', include=FALSE>>=
# child1.rnw runs source("codeA.R")
@

% attempt 2: run source file defining codeB object directly
<<pre-results2>>=
  source("codeB.R")
@

% Methods section from tex file
\input{methods}
% in this file we try to grab the two objects codeA and codeB
% Referencing codeA: \Sexpr{codeA}
% Referencing codeB: \Sexpr{codeB}

\section*{Results}
% we know this works: define codeC and reference in the master file
<<results>>=
  codeC <- 5
  print(codeC)
@

Referencing codeC: \Sexpr{codeC}

\end{document}

Answer 1

knit不解析 tex 命令，所以 methods.tex不会在 knit 上读出亭时间。

对于解决方法，试试这个:

<<knitr, include=FALSE>>=
  library(knitr)
  opts_knit$set(self.contained=FALSE)
  file.copy("methods.tex", "methods.rnw")
@

\documentclass{article}
\begin{document}

<<pre-results1, child='child.rnw', include=FALSE>>=
@
<<pre-results2>>=
  source("codeB.R")
@

% Methods section from rnw file
<<child="methods.rnw">>=
@ 

\end{document}