r - 脚本如何在从命令行运行的 R 中找到自己？

Question

我有一个脚本(称之为 Main.R )，当我运行它时，它有以下代码可以找到自己:

frame_files <- lapply(sys.frames(), function(x) x$ofile)
frame_files <- Filter(Negate(is.null), frame_files) 
main.dir <- dirname(dirname(frame_files[[length(frame_files)]]))

这用于获取其自身目录之上的目录， main.dir ，用于调用与此路径相关的其他脚本。

例如，我有兴趣从命令行运行此脚本

R CMD BATCH Main.R

或者

Rscript Main.R

不幸的是，当我从命令行调用脚本时，上面的命令不起作用。

有没有我可以输入的代码 Main.R或看涨期权 R或 Rscript我可以用它代替吗？

更具体地说，该解决方案需要在 Windows 中运行。

Answer 1

下面是一个解决方案，当使用 source 运行脚本时，它会给你正确的文件目录路径。或使用 Rscript。

# this is wrapped in a tryCatch. The first expression works when source executes, the
# second expression works when R CMD does it.
full.fpath <- tryCatch(normalizePath(parent.frame(2)$ofile),  # works when using source
               error=function(e) # works when using R CMD
                     normalizePath(unlist(strsplit(commandArgs()[grep('^--file=', commandArgs())], '='))[2]))
dirname(full.fpath)

关键是函数 normalizePath .给定一个相对或缩写的路径名， normalizePath将返回有效路径或引发错误。从 Rscript 运行脚本时，如果你给 normalizePath当前脚本的基本文件名，它将返回完整路径，无论您当前的目录是什么。当您提供 R CMD 的相对路径并且当前目录中有一个同名的脚本时，它甚至会得到正确的路径!

在上面的代码中，我从 commandArgs 返回的字符串之一中提取文件名。 .如果你看一下 commandArgs 的输出，你会看到文件名是第四个参数。参数记录为“--file=yourscript.R”，因此在上面的最后一行中，我将字符串拆分为“=”并拉出文件名。