python - 找不到包: *. pxd文件的Cython C级接口(interface)

Question

简而言之

我尝试编译一个名为 extension2 的 cython 扩展cimports 文件 extension来自自创建的包。建时extension2 , 我得到了 extension.pxd 的错误尽管此文件正好位于指定的路径中，但未找到。

详情

我正在构建两个涉及 cython 的包，一个包 A和一个包裹B这取决于 A . A是命名空间包 nsp 的子包.也就是说，文件夹结构如下所示:

├── nsp
│   └── A
|       ├── extension.pxd
|       ├── extension.pyx
│       └── __init__.py
└── setup.py

在这里， setup.py内容如下:

from setuptools import setup
from setuptools.extension import Extension

# factory function
def my_build_ext(pars):
    # import delayed:
    from setuptools.command.build_ext import build_ext as _build_ext

    # include_dirs adjusted: 
    class build_ext(_build_ext):
        def finalize_options(self):
            _build_ext.finalize_options(self)
            # Prevent numpy from thinking it is still in its setup process:
            __builtins__.__NUMPY_SETUP__ = False
            import numpy
            self.include_dirs.append(numpy.get_include())

    #object returned:
    return build_ext(pars)

extensions = [Extension(nsp.A.extension, ['nsp/A/extension.cpp'])]

setup(
    cmdclass={'build_ext' : my_build_ext},
    setup_requires=['numpy'],
    install_requires=['numpy'], 
    packages=['nsp.A'],
    ext_modules=extensions
    package_data={
        'nsp/A': ['*.pxd', '*.pyx']
    },
)

安装文件的灵感来自 add-numpy-get-include-argument-to-setuptools-without-preinstalled-numpy和 distributing-cython-modules . cython 文件已经成功转换为 .cpp文件与另一个脚本。

我安装了包 A和

pip install .

在 setup.py 的目录中.一切正常，我可以在 ...\Anaconda3\Lib\site-packages\nsp\A 下找到包的所有文件，包括 *.pxd文件。

现在我寻求创建一个 *.cpp extension2 的文件以便稍后在第二个包中打包 B .文件 extension2.pxd阅读

from nsp.A.extension cimport mymethod

创建 *.cpp 的脚本文件读取

from distutils.core import setup, Extension
from Cython.Build import cythonize
import numpy as np
import sys
print(sys.executable)

NAME = 'extension2'
extensions = [Extension(NAME, [NAME+'.pyx'],
                        include_dirs=[np.get_include()]
                        )
              ]

setup(name=NAME,
      ext_modules = cythonize(extensions, language="c++", 
                              compiler_directives=compiler_directives),
      include_dirs=[np.get_include()]
      ) 

当我使用 python myscript build_ext --inplace 运行此脚本时，我收到一个错误，指示 pxd文件丢失:

from nsp.A.extension cimport mymethod
^
------------------------------------------------------------

.\extension2.pxd:11:0: 'nsp\A\extension.pxd' not found

但是，该文件正好存在于那里。 ( sys.executable 是包含已安装包的 Anaconda3 文件夹)我该如何解决这个问题？

附加信息

我在 Windows x64 上使用 python 3.7

Answer 1

Cython 不支持 implicit namespace packages到目前为止。也就是说，cython 只搜索包含文件 init.* 的子目录。 , 由此 *可以是 py 中的任何内容, pyc , pyx , 和 pxd .

我创建了一个 bugtracker report for this issue ，如果您想跟进该问题是否已在较新版本中得到修复(我使用的是 Cython 0.29.14)。

在此之前，解决方法是创建一个空文件 __init__.pxd在文件夹 nsp .这个文件应该被 python 忽略，因为它不是 *.py文件，并让 cython 在子目录中搜索包。文件结构如下:

├── nsp
│   ├── __init__.pxd
│   └── A
|       ├── extension.pxd
|       ├── extension.pyx
│       └── __init__.py
└── setup.py

安装附加文件 __init__.pxd在命名空间包中，更改 packages setup(...) 的论据至 packages=['nsp', 'nsp.A']和 package_data论据 package_data={'': ['*.pxd', '*.pyx']} .

编辑:

该错误已为 cython 开发人员所知，并将在版本 3 中修复。请参阅 Fix for cimport from PEP420 namespace .