r - installr 不会将软件包复制到新版本的 R

Question

我最近使用了 installr包来更新我的 R 版本(从 3.6.2 到 4.0.0)。更新成功，我已经确认使用print(R.version) .但是，尽管我关注了 these，但我从旧版本的 R 中得到的包并没有复制到新版本中。信的步骤。我也试过运行 copy.packages.between.libraries(ask = T)将包复制过来。两次都返回 No packages to copy. Goodbye :) ，尽管我无法加载以前安装在旧版本上的任何软件包。

Answer 1

这是因为从 R 3.6.x 更新到 4.x 需要您重新安装所有软件包(请参阅 news )。
我发现这样做的最好方法是:

拿到你的旧包裹

old_packages <- installed.packages(lib.loc = "/home/johannes/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/")

当然，您必须将路径更改为包所在的路径。只需使用 .libPaths()如果您已经安装了新的 R 版本，请替换 4.0与 3.6 .

根据已安装的软件包检查旧的:

new_packages <- installed.packages()
missing_df <- as.data.frame(old_packages[
  !old_packages[, "Package"] %in% new_packages[, "Package"], 
  ])

安装缺少的软件包(使用多核以提高速度)install.packages(missing_df$Package, Ncpus = 3)

我前段时间在我的博客上写了这个 here ，但这些是必不可少的步骤，您应该很高兴。