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r - 遍历 df,grep,然后拆分

转载 作者:行者123 更新时间:2023-12-04 12:17:03 24 4
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我想遍历多个数据框和每个数据框中的某些列,并将括号中带有星号的数字列分成两列。例如,将 [123]*** 拆分为包含 123(无括号)的列和包含 *** 的列。这是我尝试过的:

require(reshape2)
# create dataframes
df1 <- data.frame(var=c("item1", "item2"),
var.se.1=c("[123]**", "[456]"),
var.se.2=c("[1]***", "[45]*"))
df2 <- data.frame(var=c("item3", "item4"),
var.se.1=c("[7]*", "[89]***"),
var.se.2=c("[34]**", "[2]"))

我有:

# df1
# var var.se.1 var.se.2
# 1 item1 [123]** [1]***
# 2 item2 [456] [45]*

我要:

#     var var.se.1 var.se.1.ast var.se.2 var.se.2.ast
# 1 item1 123 ** 1 ***
# 2 item2 456 45 *

我试过:

# create list of dataframes
dfs <- list(df1, df2)
# loop through dataframes
for (i in 1:length(dfs)) {
# index columns with .se in the name
seCols <- grep(".se", names(dfs[[i]]))
# loop through every column with .se in the name
for (s in seCols) {
# remove [, which will leave ] to split on
# want to get rid of [] anyway
dfs[[i]][,s] <- gsub("\\[", "", as.character(dfs[[i]][,s]))
# split into two columns on ]
dfs[[i]] <- cbind(dfs[[i]],
colsplit(dfs[[i]][,s],
pattern = "\\]",
names = c(names(dfs[[i]][s]),
paste(names(dfs[[i]][s]),
"ast", sep="."))))
}
}

代码主要执行我希望它执行的操作,但结果并未存储在数据框中。如果我运行循环然后运行 ​​dfs[[i]],那么当 i==2 时,我得到以下信息:

# i == 2
dfs[[i]]
var var.se.1 var.se.2 var.se.1 var.se.1.ast var.se.2 var.se.2.ast
1 item3 7]* 34]** 7 * 34 **
2 item4 89]*** 2] 89 *** 2

我需要删除第 2 列和第 3 列,但除此之外,一切正常。只需要将第 1、4、5、6 和 7 列(列命名正确)放入 df1df2(df2 在这个例)。

更新

我的实际用例比 MRE 更复杂并且破坏了@Tyler 的代码。这个问题似乎与我的真实数据框有不同数量的观察有关。如果我们将 df2 重新定义为 3 行,并将 df2 保留为 2 行,则 R 在运行@Tyler 的代码时将抛出错误:“数据.frame 错误(。 .., check.names = FALSE) :参数暗示不同的行数:2、3"

df2 <- data.frame(var=c("item3", "item4", "item5"),
var.se.1=c("[7]*", "[89]***", "new"),
var.se.2=c("[34]**", "[2]", "rows"))

最佳答案

这是使用 qdap 包的一种方法。我根据 OP 的评论做了一些调整。我会在列表之外操作,但如果您希望它们在全局环境中,我也会提供。

L1 <- setNames(list(df1, df2), c("df1", "df2"))

library(qdap)

bot_scum <- function(x) identical(character(0), x)
FUN <- function(x) {
y <- bracketXtract(x)
y[sapply(y, bot_scum)] <- NA
as.numeric(unlist(y))
}
FUN2 <- function(x) gsub("[^*]", "", x)
FUN3 <- function(x) cbind.data.frame(FUN(x), FUN2(x))

(L2 <- lapply(L1, function(x) {
inds <- grep(".se", colnames(x), fixed=TRUE)
ninds <- grep(".se", colnames(x), fixed=TRUE, invert=TRUE)

out <- do.call(cbind.data.frame, lapply(inds, function(i) {
setNames(FUN3(x[, i]), c(colnames(x)[i], paste0(colnames(x)[i], ".ast")))
}))

cbind.data.frame(x[, ninds, drop=FALSE],out)
}))

list2env(L2, envir = .GlobalEnv)
df1
df2

## $df1
## var var.se.1 var.se.1.ast var.se.2 var.se.2.ast
## 1 item1 123 ** 1 ***
## 2 item2 456 45 *
##
## $df2
## var var.se.1 var.se.1.ast var.se.2 var.se.2.ast
## 1 item3 7 * 34 **
## 2 item4 89 *** 2

关于r - 遍历 df,grep,然后拆分,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/23419247/

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